Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03082
• Subject: XM_017024545.1
• Aligned Length: 1005
• Identities: 798
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGAAGAATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  74
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  58

Query   75  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCTGAGGAGAAAGGCGGATTGGTATCTGATGCCTATGGGGAGGATG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct   59  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCT-------------------------------------------  89

Query  149  ACTTTTCTCGTCTAGGGGGTGATGAAGATGGTTATGAAGAAGAAGAAGATGAGAACAGTAGACAGTCGGAAGAT  222
                                                                               |||||||
Sbjct   90  -------------------------------------------------------------------GGAAGAT  96

Query  223  GACGATTCAGAGACTGAAAAACCTGAGGCTGATGACCCAAAGGATAATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  GACGATTCAGAGACTGAAAAACCTGAGGCTGATGACCCAAAGGATAATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCA  170

Query  297  GGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCTGATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  GGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCTGATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCC  244

Query  371  CTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTATGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  CTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTATGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGAT  318

Query  445  ATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCATCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  ATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCATCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGC  392

Query  519  CATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCCCATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  CATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCCCATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATG  466

Query  593  AGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAAGGCCAAAAAGGAGCGAACAAAA------  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  467  AGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAAGGCCAAAAAGGAGCGAACAAAAGCTTGT  540

Query  661  --------------------------------------------------------------------------  660
                                                                                      
Sbjct  541  TGCAGGGACGTGTCTGCAGCGCCTGGGGACCGGAGCTGTCCTTCCCCTGTGCGGGCGGGCACCGCCTCCTCCTG  614

Query  661  -ATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCACCACCACTACCACTGCCAGCA  733
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  GATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCACCACCACTACCACTGCCAGCA  688

Query  734  CAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCAGTGACAACGATAGCCCAGCCC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  CAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCAGTGACAACGATAGCCCAGCCC  762

Query  808  ACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAGCGCCAGCGGCTCCAAGACCAC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  ACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAGCGCCAGCGGCTCCAAGACCAC  836

Query  882  CGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  CGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  879