Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03136
• Subject: NM_173197.2
• Aligned Length: 774
• Identities: 528
• Gaps: 240

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGG-  73

Query  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148
                                                                                     
Sbjct  74  --------------------------------------------------------------------------  73

Query 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAAACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGT  222
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  74  ---------------------ACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGT  126

Query 223  CTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127  CTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGA  200

Query 297  ATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201  ATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCA  274

Query 371  GCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 275  GCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTT------------  336

Query 445  GCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAA  518
                                                                                     
Sbjct 337  --------------------------------------------------------------------------  336

Query 519  CAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACA  592
                                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337  ----------------------GAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACA  388

Query 593  CGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 389  CGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAG  462

Query 667  GATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGATGAGAACATCATGAGGTCCATGCAGCT  740
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |.||      ||.|||.||| .||
Sbjct 463  GATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAG-----GTAC------AGCTCCCTGC-CCT  524

Query 741  CTTTGACAATGTCATC------------------  756
           ||   |||   |.|.|                  
Sbjct 525  CT---ACA---TTACCCTGACCTGGACTCAGGCC  552