Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03136
• Subject: XM_017318315.1
• Aligned Length: 810
• Identities: 697
• Gaps: 54

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
           |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct   1  ATGCGGGGCCAAGGCCGAAAGGAGAGTTTGTCCGAATCCCGAGATTTGGACGGCTCCTATGACCAGCTTACGGG  74

Query  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAGCGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148
           |||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCACCCTCCAGGGCCCAGTAAAAAAGCCCTGAAGCAGCGTTTCCTCAAGCTGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAG  148

Query 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAA-----------------------------------------------------  169
           |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 149  CCCTGCCCTCAGTCAGTGAAACATTAGCTGCCCCAGCCTCCCTCCGCCCCCACAGACCCCGCCCGCTGGACCCA  222

Query 170  -ACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCA  242
            ||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 223  GACAGCGTGGAGGATGAGTTTGAACTATCCACGGTGTGCCACCGGCCTGAGGGTCTGGAACAACTCCAGGAACA  296

Query 243  AACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCA  316
           ||||||.|||||.||||..||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AACCAAGTTCACACGCAGAGAGTTGCAGGTCCTGTACAGAGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCA  370

Query 317  ATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTC  390
           |.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 371  ACGAGGAGAACTTCAAGCAAATTTATTCTCAGTTCTTTCCCCAAGGAGACTCCAGCAACTACGCTACTTTTCTC  444

Query 391  TTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCT  464
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445  TTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCTGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCAGTGATTCT  518

Query 465  TCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCA  538
           |||||||||..|||||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 519  TCGGGGAACCATAGATGATAGACTGAACTGGGCTTTCAACTTATATGACCTCAACAAGGATGGCTGTATCACGA  592

Query 539  AGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAG  612
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593  AGGAGGAAATGCTCGACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACCTACCCTGCCCTCCGGGAG  666

Query 613  GAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGA  686
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 667  GAGGCCCCGAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGACGGCGTGGTGACCATTGA  740

Query 687  GGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGATGAGAACATCATGAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
           ||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 741  GGAATTCATTGAGTCTTGTCAACAGGACGAGAACATCATGAGGTCCATGCAACTCTTTGATAATGTCATC  810