Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03161
• Subject: NM_054039.2
• Aligned Length: 1297
• Identities: 1096
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGCCCAACCCCAGGCCTGGCAAGCCCTCGGCCCCTTCCTTGGCCCTTGGCCCATCCCCAGGAGCCTCGCCCAG  74
            |||||||||||.|||||.|.||||||...|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct    1  ATGCCCAACCCTAGGCCAGCCAAGCCTATGGCTCCTTCCTTGGCCCTTGGCCCATCCCCAGGAGTCTTGCCAAG  74

Query   75  CTGGAGGGCTGCACCCAAAGCCTCAGACCTGCTGGGGGCCCGGGGCCCAGGGGGAACCTTCCAGGGCCGAGATC  148
            |||||.|.||||||||||.|.||||||.||.||.|||.||.|||||.|.||||||.|||||||.||.||.||.|
Sbjct   75  CTGGAAGACTGCACCCAAGGGCTCAGAACTTCTAGGGACCAGGGGCTCTGGGGGACCCTTCCAAGGTCGGGACC  148

Query  149  TTCGAGGCGGGGCCCATGCCTCCTCTTCTTCCTTGAACCCCATGCCACCATCGCAGCTGCAGCTGCCCACACTG  222
            |.|||.|.||||||||   |.||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct  149  TGCGAAGTGGGGCCCA---CACCTCTTCTTCCTTGAACCCCCTGCCACCATCCCAGCTGCAGCTGCCTACAGTG  219

Query  223  CCCCTAGTCATGGTGGCACCCTCCGGGGCACGGCTGGGCCCCTTGCCCCACTTACAGGCACTCCTCCAGGACAG  296
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||||||||||
Sbjct  220  CCCCTAGTCATGGTGGCACCGTCTGGGGCCCGACTAGGTCCCTCACCCCACCTACAGGCCCTTCTCCAGGACAG  293

Query  297  GCCACATTTCATGCACCAGCTCTCAACGGTGGATGCCCACGCCCGGACCCCTGTGCTGCAGGTGCACCCCCTGG  370
            .|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||.||.||||..||.||||
Sbjct  294  ACCACACTTCATGCATCAGCTCTCCACTGTGGATGCCCATGCCCAGACCCCTGTGCTCCAAGTGCGTCCACTGG  367

Query  371  AGAGCCCAGCCATGATCAGCCTCACACCACCCACCACCGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAGGCCCGGCCTGGC  444
            |.|.|||||||||||||||||||.|||||||..|..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  ACAACCCAGCCATGATCAGCCTCCCACCACCTTCTGCTGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAGGCCCGGCCTGGC  441

Query  445  CTCCCACCTGGGATCAACGTGGCCAGCCTGGAATGGGTGTCCAGGGAGCCGGCACTGCTCTGCACCTTCCCAAA  518
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||..
Sbjct  442  CTGCCACCTGGGATCAATGTGGCCAGTCTGGAATGGGTGTCCAGGGAGCCAGCTCTACTCTGCACCTTCCCACG  515

Query  519  TCCCAGTGCACCCAGGAAGGACAGCACCCTTTCGGCTGTGCCCCAGAGCTCCTACCCACTGCTGGCAAATGGTG  592
            ..|..||.||||||||||.|||||||.|||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  516  CTCGGGTACACCCAGGAAAGACAGCAACCTTTTGGCTGCACCCCAAGGATCCTACCCACTGCTGGCAAATGGAG  589

Query  593  TCTGCAAGTGGCCCGGATGTGAGAAGGTCTTCGAAGAGCCAGAGGACTTCCTCAAGCACTGCCAGGCGGACCAT  666
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  590  TCTGCAAGTGGCCTGGTTGTGAGAAGGTCTTCGAGGAGCCAGAAGAGTTTCTCAAGCACTGCCAAGCAGATCAT  663

Query  667  CTTCTGGATGAGAAGGGCAGGGCACAATGTCTCCTCCAGAGAGAGATGGTACAGTCTCTGGAGCAGCAGCTGGT  740
            ||.|||||||||||.||||.|||.||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  664  CTCCTGGATGAGAAAGGCAAGGCCCAGTGCCTCCTCCAGAGAGAAGTGGTGCAGTCTCTGGAGCAGCAGCTGGA  737

Query  741  GCTGGAGAAGGAGAAGCTGAGTGCCATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAAATGGCACTGACCAAGGCTTCATCTG  814
            ||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct  738  GCTGGAAAAGGAGAAGCTGGGAGCTATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAGATGGCGCTGGCCAAGGCTCCATCTG  811

Query  815  TGGCATCATCCGACAAGGGCTCCTGCTGCATCGTAGCTGCTGGCAGCCAAGGCCCTGTCGTCCCAGCCTGGTCT  888
            ||||.|||...||||||.||||.||||||||||||||..|..|.|..||.|||..|||..||||.|||||||||
Sbjct  812  TGGCCTCAATGGACAAGAGCTCTTGCTGCATCGTAGCCACCAGTACTCAGGGCAGTGTGCTCCCGGCCTGGTCT  885

Query  889  GGCCCCCGGGAGGCCCCTGA---CAGCCTGTTTGCTGTCCGGAGGCACCTGTGGGGTAGCCATGGAAACAGCAC  959
            |..||.||||||||.||.||   |.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||..|
Sbjct  886  GCTCCTCGGGAGGCTCCAGACGGCGGCCTGTTTGCAGTGCGGAGGCACCTCTGGGGAAGCCATGGCAATAGTTC  959

Query  960  ATTCCCAGAGTTCCTCCACAACATGGACTACTTCAAGTTCCACAACATGCGACCCCCTTTCACCTACGCCACGC  1033
            .||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  960  CTTCCCAGAGTTCTTCCACAACATGGACTACTTCAAGTACCACAATATGCGACCCCCTTTCACCTATGCCACCC  1033

Query 1034  TCATCCGCTGGGCCATCCTGGAGGCTCCAGAGAAGCAGCGGACACTCAATGAGATCTACCACTGGTTCACACGC  1107
            |.|||||.||||||||||||||.||.||.||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1034  TTATCCGATGGGCCATCCTGGAAGCCCCGGAGAGGCAGAGGACACTCAATGAAATCTACCATTGGTTTACTCGC  1107

Query 1108  ATGTTTGCCTTCTTCAGAAACCATCCTGCCACCTGGAAGAACGCCATCCGCCACAACCTGAGTCTGCACAAGTG  1181
            |||||.||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1108  ATGTTCGCCTACTTCAGAAACCACCCCGCCACCTGGAAGAATGCCATCCGCCACAACCTGAGCCTGCACAAGTG  1181

Query 1182  CTTTGTGCGGGTGGAGAGCGAGAAGGGGGCTGTGTGGACCGTGGATGAGCTGGAGTTCCGCAAGAAACGGAGCC  1255
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||..||||||
Sbjct 1182  CTTTGTGCGAGTGGAGAGCGAGAAGGGAGCAGTGTGGACCGTAGATGAATTTGAGTTTCGCAAGAAGAGGAGCC  1255

Query 1256  AGAGGCCCAGCAGGTGTTCCAA-CCCTACACCTGGCCCC  1293
            |..|.||||.||.|||.||||| ||||.| |||      
Sbjct 1256  AACGCCCCAACAAGTGCTCCAATCCCTGC-CCT------  1287