Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03161
- Subject:
- NM_054039.2
- Aligned Length:
- 1297
- Identities:
- 1096
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGCCCAACCCCAGGCCTGGCAAGCCCTCGGCCCCTTCCTTGGCCCTTGGCCCATCCCCAGGAGCCTCGCCCAG 74
|||||||||||.|||||.|.||||||...|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct 1 ATGCCCAACCCTAGGCCAGCCAAGCCTATGGCTCCTTCCTTGGCCCTTGGCCCATCCCCAGGAGTCTTGCCAAG 74
Query 75 CTGGAGGGCTGCACCCAAAGCCTCAGACCTGCTGGGGGCCCGGGGCCCAGGGGGAACCTTCCAGGGCCGAGATC 148
|||||.|.||||||||||.|.||||||.||.||.|||.||.|||||.|.||||||.|||||||.||.||.||.|
Sbjct 75 CTGGAAGACTGCACCCAAGGGCTCAGAACTTCTAGGGACCAGGGGCTCTGGGGGACCCTTCCAAGGTCGGGACC 148
Query 149 TTCGAGGCGGGGCCCATGCCTCCTCTTCTTCCTTGAACCCCATGCCACCATCGCAGCTGCAGCTGCCCACACTG 222
|.|||.|.|||||||| |.||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 149 TGCGAAGTGGGGCCCA---CACCTCTTCTTCCTTGAACCCCCTGCCACCATCCCAGCTGCAGCTGCCTACAGTG 219
Query 223 CCCCTAGTCATGGTGGCACCCTCCGGGGCACGGCTGGGCCCCTTGCCCCACTTACAGGCACTCCTCCAGGACAG 296
||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||||||||||
Sbjct 220 CCCCTAGTCATGGTGGCACCGTCTGGGGCCCGACTAGGTCCCTCACCCCACCTACAGGCCCTTCTCCAGGACAG 293
Query 297 GCCACATTTCATGCACCAGCTCTCAACGGTGGATGCCCACGCCCGGACCCCTGTGCTGCAGGTGCACCCCCTGG 370
.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||.||.||||..||.||||
Sbjct 294 ACCACACTTCATGCATCAGCTCTCCACTGTGGATGCCCATGCCCAGACCCCTGTGCTCCAAGTGCGTCCACTGG 367
Query 371 AGAGCCCAGCCATGATCAGCCTCACACCACCCACCACCGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAGGCCCGGCCTGGC 444
|.|.|||||||||||||||||||.|||||||..|..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 ACAACCCAGCCATGATCAGCCTCCCACCACCTTCTGCTGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAGGCCCGGCCTGGC 441
Query 445 CTCCCACCTGGGATCAACGTGGCCAGCCTGGAATGGGTGTCCAGGGAGCCGGCACTGCTCTGCACCTTCCCAAA 518
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||..
Sbjct 442 CTGCCACCTGGGATCAATGTGGCCAGTCTGGAATGGGTGTCCAGGGAGCCAGCTCTACTCTGCACCTTCCCACG 515
Query 519 TCCCAGTGCACCCAGGAAGGACAGCACCCTTTCGGCTGTGCCCCAGAGCTCCTACCCACTGCTGGCAAATGGTG 592
..|..||.||||||||||.|||||||.|||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 516 CTCGGGTACACCCAGGAAAGACAGCAACCTTTTGGCTGCACCCCAAGGATCCTACCCACTGCTGGCAAATGGAG 589
Query 593 TCTGCAAGTGGCCCGGATGTGAGAAGGTCTTCGAAGAGCCAGAGGACTTCCTCAAGCACTGCCAGGCGGACCAT 666
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 590 TCTGCAAGTGGCCTGGTTGTGAGAAGGTCTTCGAGGAGCCAGAAGAGTTTCTCAAGCACTGCCAAGCAGATCAT 663
Query 667 CTTCTGGATGAGAAGGGCAGGGCACAATGTCTCCTCCAGAGAGAGATGGTACAGTCTCTGGAGCAGCAGCTGGT 740
||.|||||||||||.||||.|||.||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 664 CTCCTGGATGAGAAAGGCAAGGCCCAGTGCCTCCTCCAGAGAGAAGTGGTGCAGTCTCTGGAGCAGCAGCTGGA 737
Query 741 GCTGGAGAAGGAGAAGCTGAGTGCCATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAAATGGCACTGACCAAGGCTTCATCTG 814
||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 738 GCTGGAAAAGGAGAAGCTGGGAGCTATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAGATGGCGCTGGCCAAGGCTCCATCTG 811
Query 815 TGGCATCATCCGACAAGGGCTCCTGCTGCATCGTAGCTGCTGGCAGCCAAGGCCCTGTCGTCCCAGCCTGGTCT 888
||||.|||...||||||.||||.||||||||||||||..|..|.|..||.|||..|||..||||.|||||||||
Sbjct 812 TGGCCTCAATGGACAAGAGCTCTTGCTGCATCGTAGCCACCAGTACTCAGGGCAGTGTGCTCCCGGCCTGGTCT 885
Query 889 GGCCCCCGGGAGGCCCCTGA---CAGCCTGTTTGCTGTCCGGAGGCACCTGTGGGGTAGCCATGGAAACAGCAC 959
|..||.||||||||.||.|| |.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||..|
Sbjct 886 GCTCCTCGGGAGGCTCCAGACGGCGGCCTGTTTGCAGTGCGGAGGCACCTCTGGGGAAGCCATGGCAATAGTTC 959
Query 960 ATTCCCAGAGTTCCTCCACAACATGGACTACTTCAAGTTCCACAACATGCGACCCCCTTTCACCTACGCCACGC 1033
.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 960 CTTCCCAGAGTTCTTCCACAACATGGACTACTTCAAGTACCACAATATGCGACCCCCTTTCACCTATGCCACCC 1033
Query 1034 TCATCCGCTGGGCCATCCTGGAGGCTCCAGAGAAGCAGCGGACACTCAATGAGATCTACCACTGGTTCACACGC 1107
|.|||||.||||||||||||||.||.||.||||.||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1034 TTATCCGATGGGCCATCCTGGAAGCCCCGGAGAGGCAGAGGACACTCAATGAAATCTACCATTGGTTTACTCGC 1107
Query 1108 ATGTTTGCCTTCTTCAGAAACCATCCTGCCACCTGGAAGAACGCCATCCGCCACAACCTGAGTCTGCACAAGTG 1181
|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1108 ATGTTCGCCTACTTCAGAAACCACCCCGCCACCTGGAAGAATGCCATCCGCCACAACCTGAGCCTGCACAAGTG 1181
Query 1182 CTTTGTGCGGGTGGAGAGCGAGAAGGGGGCTGTGTGGACCGTGGATGAGCTGGAGTTCCGCAAGAAACGGAGCC 1255
|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||..||||||
Sbjct 1182 CTTTGTGCGAGTGGAGAGCGAGAAGGGAGCAGTGTGGACCGTAGATGAATTTGAGTTTCGCAAGAAGAGGAGCC 1255
Query 1256 AGAGGCCCAGCAGGTGTTCCAA-CCCTACACCTGGCCCC 1293
|..|.||||.||.|||.||||| ||||.| |||
Sbjct 1256 AACGCCCCAACAAGTGCTCCAATCCCTGC-CCT------ 1287