Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03168
• Subject: XM_006514039.2
• Aligned Length: 1165
• Identities: 899
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGAAGCTCGCGGGAGAGGGGAGGAGCCAGCACCCTAATCCTGGCTACTCCAACTCCACCCAGGACTTTCC  74

Query    1  ----------------ATGGAAGTTCTGCGTCCACAGCTTATAAGAATTGATGGCCGGAATTACAGGAAGAATC  58
                            |||||.|||||.||.||||||.||.|||...|.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  TGGAACGTCATTTGTCATGGATGTTCTACGCCCACAGATTGTAACGTTCGATGGACGGAATTATAGAAAGAATC  148

Query   59  CAGTCCAAG---AACAGACCTATCAACATGAAGAAGATGAAGAGGACTTCTATCAAGGCTCCATGGAGTGTGCT  129
            |..||||.|   |||||   ||.||||||||||||   ||.|||||.|||||||..|.|||||||||.|...||
Sbjct  149  CCATCCAGGAGAAACAG---TACCAACATGAAGAA---GACGAGGATTTCTATCCTGACTCCATGGAATACTCT  216

Query  130  GATGAGCCCTGTGATGCCTACGAGGTGGAGCAGACCCCACAAGGATTCCGGTCTACTTTGAGGGCCCCCAGCTT  203
            |||||||||||.|.||||||||||||||..||||||||.||.|||||||||.|.||..|.||.|||||.|||.|
Sbjct  217  GATGAGCCCTGCGGTGCCTACGAGGTGGCACAGACCCCTCACGGATTCCGGGCCACCGTCAGTGCCCCTAGCCT  290

Query  204  GCTCTATAAGCATATAGTTGGAAAGAGAGGGGACACTAGGAAGAAAATAGAAATGGAGACCAAAACTTCTATTA  277
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|.|||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||
Sbjct  291  GCTCTACAAGCACATAGTTGGAAAGAGAGGGGATACCAAGAAAAAGATAGAAGTGGAGACTAAAACATCTATTA  364

Query  278  GCATTCCTAAACCTGGACAAGACGGGGAAATTGTAATCACTGGCCAGCATCGAAATGGTGTAATTTCAGCCCGA  351
            .||||||.||.|.|||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||.|||
Sbjct  365  ACATTCCGAAGCATGGGCATGAAGGGGAAATCGTGATCACTGGTCAGCATCGAAATGGCGTGGTCTCAGCGCGA  438

Query  352  ACACGGATTGATGTTCTTTTGGACACTTTTCGAAGAAAGCAGCCCTTCACTCACTTCCTTGCCTTTTTCCTCAA  425
            ||||||||.||.||.||..|||||||.||..|.||.|.||||||.||.||.|||||||||.||||.||||||||
Sbjct  439  ACACGGATCGACGTGCTCCTGGACACGTTCAGGAGGAGGCAGCCTTTTACCCACTTCCTTTCCTTCTTCCTCAA  512

Query  426  TGAAGTTGAGGTTCAGGAAGGATTCCTGAGATTCCAGGAGGAAGTACTGGCGAAGTGCTCCATGGATCATGGGG  499
            |||||||||||||||||||.|.||.||||..|||||||||||.||.|||..|||||||||||.|||||.|||.|
Sbjct  513  TGAAGTTGAGGTTCAGGAACGGTTTCTGATGTTCCAGGAGGAGGTGCTGAGGAAGTGCTCCAAGGATCGTGGAG  586

Query  500  TTGACAGCAGCATTTTCCAGAATCCTAAAAAGCTTCATCTAACTATTGGGATGTTGGTGCTTTTGAGTGAGGAA  573
            ||||.||||.||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||.|.
Sbjct  587  TTGATAGCACCATTTTTCAGAACCCCAAAAAGCTTCACCTAACTATTGGGATGTTGGTACTTCTAAGTGAGCAG  660

Query  574  GAGATCCAGCAGACATGTGAGATGCTACAGCAGTGTAAAGAGGAATTCATTAATGATATTTCTGGGGGTAAACC  647
            ||||||||||||||.||||||||.||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|.|||
Sbjct  661  GAGATCCAGCAGACGTGTGAGATCCTGCAGCGCTGTAAAGAGGAATTCATTAATGACATTTCTGGAGGCAGACC  734

Query  648  CCTAGAAGTGGAGATGGCAGGGATAGAATACATGAATGATGATCCTGGCATGGTGGATGTTCTTTACGCCAAAG  721
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  735  CCTGGAAGTCGAGATGGCAGGCATCGAATACATGAATGACGATCCTGCTATGGTGGATGTTCTTTATGCCAAAG  808

Query  722  TCCATATGAAAGATGGCTCCAACAGGCTACAAGAATTAGTTGATCGAGTGCTGGAACGTTTTCAGGCATCT-GG  794
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||.| .|| ||
Sbjct  809  TCCACATGAAAGATGGCTCCAACAGGCTGCAGGAGCTGGTTGATCGAGTGCTGGAGCGTTTTCAGTC-CCTGGG  881

Query  795  ACTAATAGTGAAAGAGTGGAATAGTGTGAAACTGCATGCTACAGTTATGAATACACTATTCAGGAAAGACCCCA  868
            |||.||.|||||||||||||..||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct  882  ACTCATCGTGAAAGAGTGGACCAGTGTGAAACTGCACGCCACGGTCATGAACACACTGCTCAGGAAAGACCCCA  955

Query  869  ATGCTGAAGGCAGGTACAATCTCTACACAGCGGAAGGCAAATATATCTTCAAGGAAAGAGAATCATTTGATGGC  942
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  956  ACGCGGAAGGCAGGTACAATCTCTACACAGCAGATGGCAAATATATCTTCAAGGAGAGAGAGTCTTTTGATGGC  1029

Query  943  CGAAATATTTTAAAGTTGTTTGAGAACTTCTACTTTGGCTCCCTAAAGCTGAATTCAATTCACATCTCTCAGAG  1016
            ||.||.|||||||||...||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1030  CGGAACATTTTAAAGACATTTGAGAACTTCTACTTTGGTTCCCTGAGGCTCAATTCTATTCACATCTCCCAGAG  1103

Query 1017  GTTCACCGTAGACAGCTTTGGAAACTACGCTTCCTGTGGACAAATTGACTTCTCC  1071
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||
Sbjct 1104  GTTCACGGTGGACAGCTTTGGAAACTATGCCTCCTGCGGACATGTTGACTTCTCC  1158