Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03168
- Subject:
- XM_006514040.3
- Aligned Length:
- 1075
- Identities:
- 899
- Gaps:
- 11
Alignment
Query 1 ATGGAAGTTCTGCGTCCACAGCTTATAAGAATTGATGGCCGGAATTACAGGAAGAATCCAGTCCAAG---AACA 71
|||||.|||||.||.||||||.||.|||...|.|||||.||||||||.||.||||||||..||||.| ||||
Sbjct 1 ATGGATGTTCTACGCCCACAGATTGTAACGTTCGATGGACGGAATTATAGAAAGAATCCCATCCAGGAGAAACA 74
Query 72 GACCTATCAACATGAAGAAGATGAAGAGGACTTCTATCAAGGCTCCATGGAGTGTGCTGATGAGCCCTGTGATG 145
| ||.|||||||||||| ||.|||||.|||||||..|.|||||||||.|...|||||||||||||.|.||
Sbjct 75 G---TACCAACATGAAGAA---GACGAGGATTTCTATCCTGACTCCATGGAATACTCTGATGAGCCCTGCGGTG 142
Query 146 CCTACGAGGTGGAGCAGACCCCACAAGGATTCCGGTCTACTTTGAGGGCCCCCAGCTTGCTCTATAAGCATATA 219
||||||||||||..||||||||.||.|||||||||.|.||..|.||.|||||.|||.|||||||.|||||.|||
Sbjct 143 CCTACGAGGTGGCACAGACCCCTCACGGATTCCGGGCCACCGTCAGTGCCCCTAGCCTGCTCTACAAGCACATA 216
Query 220 GTTGGAAAGAGAGGGGACACTAGGAAGAAAATAGAAATGGAGACCAAAACTTCTATTAGCATTCCTAAACCTGG 293
|||||||||||||||||.||.|.|||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||.||||||.||.|.|||
Sbjct 217 GTTGGAAAGAGAGGGGATACCAAGAAAAAGATAGAAGTGGAGACTAAAACATCTATTAACATTCCGAAGCATGG 290
Query 294 ACAAGACGGGGAAATTGTAATCACTGGCCAGCATCGAAATGGTGTAATTTCAGCCCGAACACGGATTGATGTTC 367
.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 291 GCATGAAGGGGAAATCGTGATCACTGGTCAGCATCGAAATGGCGTGGTCTCAGCGCGAACACGGATCGACGTGC 364
Query 368 TTTTGGACACTTTTCGAAGAAAGCAGCCCTTCACTCACTTCCTTGCCTTTTTCCTCAATGAAGTTGAGGTTCAG 441
|..|||||||.||..|.||.|.||||||.||.||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 TCCTGGACACGTTCAGGAGGAGGCAGCCTTTTACCCACTTCCTTTCCTTCTTCCTCAATGAAGTTGAGGTTCAG 438
Query 442 GAAGGATTCCTGAGATTCCAGGAGGAAGTACTGGCGAAGTGCTCCATGGATCATGGGGTTGACAGCAGCATTTT 515
|||.|.||.||||..|||||||||||.||.|||..|||||||||||.|||||.|||.|||||.||||.||||||
Sbjct 439 GAACGGTTTCTGATGTTCCAGGAGGAGGTGCTGAGGAAGTGCTCCAAGGATCGTGGAGTTGATAGCACCATTTT 512
Query 516 CCAGAATCCTAAAAAGCTTCATCTAACTATTGGGATGTTGGTGCTTTTGAGTGAGGAAGAGATCCAGCAGACAT 589
.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||.|.||||||||||||||.|
Sbjct 513 TCAGAACCCCAAAAAGCTTCACCTAACTATTGGGATGTTGGTACTTCTAAGTGAGCAGGAGATCCAGCAGACGT 586
Query 590 GTGAGATGCTACAGCAGTGTAAAGAGGAATTCATTAATGATATTTCTGGGGGTAAACCCCTAGAAGTGGAGATG 663
|||||||.||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|.||||||.|||||.||||||
Sbjct 587 GTGAGATCCTGCAGCGCTGTAAAGAGGAATTCATTAATGACATTTCTGGAGGCAGACCCCTGGAAGTCGAGATG 660
Query 664 GCAGGGATAGAATACATGAATGATGATCCTGGCATGGTGGATGTTCTTTACGCCAAAGTCCATATGAAAGATGG 737
|||||.||.||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 661 GCAGGCATCGAATACATGAATGACGATCCTGCTATGGTGGATGTTCTTTATGCCAAAGTCCACATGAAAGATGG 734
Query 738 CTCCAACAGGCTACAAGAATTAGTTGATCGAGTGCTGGAACGTTTTCAGGCATCT-GGACTAATAGTGAAAGAG 810
||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||.| .|| |||||.||.|||||||||
Sbjct 735 CTCCAACAGGCTGCAGGAGCTGGTTGATCGAGTGCTGGAGCGTTTTCAGTC-CCTGGGACTCATCGTGAAAGAG 807
Query 811 TGGAATAGTGTGAAACTGCATGCTACAGTTATGAATACACTATTCAGGAAAGACCCCAATGCTGAAGGCAGGTA 884
||||..||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||..||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 808 TGGACCAGTGTGAAACTGCACGCCACGGTCATGAACACACTGCTCAGGAAAGACCCCAACGCGGAAGGCAGGTA 881
Query 885 CAATCTCTACACAGCGGAAGGCAAATATATCTTCAAGGAAAGAGAATCATTTGATGGCCGAAATATTTTAAAGT 958
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.
Sbjct 882 CAATCTCTACACAGCAGATGGCAAATATATCTTCAAGGAGAGAGAGTCTTTTGATGGCCGGAACATTTTAAAGA 955
Query 959 TGTTTGAGAACTTCTACTTTGGCTCCCTAAAGCTGAATTCAATTCACATCTCTCAGAGGTTCACCGTAGACAGC 1032
..||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 956 CATTTGAGAACTTCTACTTTGGTTCCCTGAGGCTCAATTCTATTCACATCTCCCAGAGGTTCACGGTGGACAGC 1029
Query 1033 TTTGGAAACTACGCTTCCTGTGGACAAATTGACTTCTCC 1071
|||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||
Sbjct 1030 TTTGGAAACTATGCCTCCTGCGGACATGTTGACTTCTCC 1068