Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03224
- Subject:
- XM_006527919.3
- Aligned Length:
- 1873
- Identities:
- 1575
- Gaps:
- 74
Alignment
Query 1 ATGGAAAACTCAGATTCCAATGACAAAGGAAGTGGTGATCAGTCTGCAGCACAGCGCAGAAGTCAGATGGACCG 74
|||||.|||||||||||.||.||.||||||| ||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGAGAACTCAGATTCTAACGATAAAGGAA---GTGACCAGTCTGCAGCTCAGCGCAGAAGTCAAATGGATCG 71
Query 75 ATTGGATCGAGAAGAAGCTTTCTATCAATTTGTAAATAACCTGAGTGAAGAAGATTATAGGCTTATGAGAGATA 148
.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 72 CTTGGATCGGGAAGAGGCTTTCTATCAATTTGTGAATAATCTCAGTGAAGAAGATTATAGACTTATGAGAGACA 145
Query 149 ACAATTTGCTAGGCACCCCAGGTGAAAGTACTGAGGAAGAGTTGCTGAGACGACTACAGCAAATTAAAGAAGGC 222
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 146 ACAATTTGCTGGGCACCCCAGGTGAAAGTACTGAGGAAGAGTTGCTCAGAAGACTACAACAAATTAAAGAGGGT 219
Query 223 CCACCACCGCAAAACTCAGATGAAAATAGAGGAGGAGACTCTTCAGATGATGTGTCTAATGGTGACTCTATAAT 296
||||||||.||.|.|.|.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||.|.||..||||.||||||||
Sbjct 220 CCACCACCACAGAGCCCCGATGAAAATAGAGCTGGAGAGTCTTCAGATGATGTGACCAACAGTGATTCTATAAT 293
Query 297 AGACTGGCTTAACTCTGTCAGACAAACTGGAAATACAACAAGAAGTGGGCAAAGAGGAAACCAATCTTGGAGAG 370
|||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 294 AGATTGGCTTAACTCAGTCAGACAGACTGGAAATACAACAAGAAGTGGTCAGAGAGGAAACCAGTCCTGGAGAG 367
Query 371 CAGTGAGTCGGACTAATCCAAACAGTGGTGATTTCAGATTCAGTTTAGAGATAAATGTTAACCGTAATAATGGG 444
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 368 CAGTGAGCCGGACTAATCCAAACAGCGGTGATTTCAGATTCAGTTTAGAGATAAATGTTAACCGTAACAATGGA 441
Query 445 AGCCAAAATTCAGAGAATGAAAATGAGCCATCTGCAAGACGTTCTAGTGGAGAAAATGTGGAAAACAACAGCCA 518
|||||||.|||.||||||||||.|||.|||||..|.||.|||..|||||.||||||..||||.|.||.||||||
Sbjct 442 AGCCAAACTTCCGAGAATGAAAGTGAACCATCCACTAGGCGTCTTAGTGTAGAAAACATGGAGAGCAGCAGCCA 515
Query 519 AAGGCAAGTGGAAAACCCACGATCTGAATCAACATCTGCAAGGCCATCTAGATCAGAACGAAATTCAACTGAAG 592
|||||||.|||||||..|...||||||||||.||||.||.||.||.|||.||.|.||.||.||||||.||||||
Sbjct 516 AAGGCAAATGGAAAATTCTGCATCTGAATCAGCATCGGCCAGACCTTCTCGAGCGGAGCGCAATTCAGCTGAAG 589
Query 593 CGTTAACAGAGGT-CCCACCTACCAGAGGTCAGAGGAGGGCAAGAAGCAGGAGCCCAGACCATCGGAGAACCAG 665
|..|||||||.|| ||.||| |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 590 CAGTAACAGAAGTGCCGACC-ACCAGAGCTCAGAGGAGGGCAAGAAGCCGGAGCCCAGAGCATCGGAGAACCAG 662
Query 666 AGCAAGAGCTGAAAGAAGTAGGTCACCTCTGCATCCAATGAGTGAAATTCCACGAAGATCTCATCATAGTATCT 739
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||
Sbjct 663 AGCAAGAGCTGAAAGAAGCAGGTCCCCTCTGCAGCCAACAAGTGAAATTCCACGAAG----------------- 719
Query 740 CATCTCAGACTTTTGAACATCCTTTGGTAAATGAGACGGAGGGAAGTTCTAGAACCCGGCACCATGTGACATTG 813
|.|||.|||.||.||.||..|||.||.|||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 720 -AGCTCCGACCTTGGAGCAGTCTTCGGAAAACGAGCCTGAAGGAAGTTCTAGAACCCGGCACCATGTGACCCTG 792
Query 814 AGGCAGCAAATATCTGGGCCTGAGTTGCTAAGTAGAGGTCTTTTTGCAGCTTCTGGAACAAGAAATGCTTCTCA 887
||.|||||.||||||||.||.||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|.|||||
Sbjct 793 AGACAGCAGATATCTGGACCGGAGTTGTTAGGTAGAGGTCTTTTTGCAGCTTCTGGATCAAGAAACCCCTCTCA 866
Query 888 AGGAGCAGGTTCTTCAGACACAGCTGCCAGTGGTGAATCTACAGGATCAGGACAGAGACCTCCAACCATAGTCC 961
.||..||.|.|||||||||||||.|..||.|.|||||||..|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 867 GGGGACAAGCTCTTCAGACACAGGTAGCAATAGTGAATCCTCAGGATCTGGCCAAAGACCTCCAACCATAGTTC 940
Query 962 TTGATCTTCAAGTAAGAAGAGTTCGTCCTGGAGAATATCGGCAGAGAGATAGCATAGCCAGCAGAACTCGGTCT 1035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 941 TTGATCTTCAAGTAAGAAGAGTTCGTCCTGGAGAATACCGGCAGAGAGATAGTATAGCTAGCAGAACTCGATCA 1014
Query 1036 AGGTCTCAGACACCAAACAACACTGTCACCTATGAAAGTGAACGAGGAGGTTTTAGGCGTACATTTTCACGTTC 1109
||.||||||.|.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1015 AGATCTCAGGCTCCGAACAACACAGTTACTTATGAAAGTGAACGTGGAGGTTTTAGGCGTACCTTTTCCCGTTC 1088
Query 1110 TGAGCGGGCAGGTGTGAGAACCTATGTCAGTACCATCAGAATTCCCATTCGTAGAATCTTAAATACTGGTTTAA 1183
|||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1089 TGAACGTGCAGGTGTGAGAACCTATGTGAGTACTATCAGGATTCCTATTCGCAGAATCTTAAATACTGGATTAA 1162
Query 1184 GTGAGACTACATCTGTTGCAATTCAGACCATGTTAAGGCAGATAATGACAGGTTTTGGTGAGTTAAGCTATTTT 1257
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1163 GTGAAACTACATCTGTTGCAATTCAAACCATGTTAAGGCAGATAATGACAGGCTTTGGTGAGCTAAGCTACTTT 1236
Query 1258 ATGTACAGTGATAGCGACTCAGAGCCTACTGGCTCAGTCTCAAATCGAAATATGGAAAGGGCAGAGTCACGGAG 1331
|||||||||||.||.||.||||||||||.||.|||||||||.|..||||||.||||.||.|.|||||||||||.
Sbjct 1237 ATGTACAGTGACAGTGATTCAGAGCCTAGTGCCTCAGTCTCCAGCCGAAATGTGGAGAGAGTAGAGTCACGGAA 1310
Query 1332 TGGAAGAGGAGGTTCTGGTGGTGGTAGTAGTTCTGGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTTCCAGTTCGAGTTCCAGTT 1405
|||||||||..|.||||||||.||||..||.|||||||||
Sbjct 1311 TGGAAGAGGGAGCTCTGGTGGCGGTAACAGCTCTGGTTCC---------------------------------- 1350
Query 1406 CCAGTTCAAGTTCCAGTTCCAGTCCTAGTTCCAGTTCCGGTGGTGAAAGTTCAGAAACTAGCTCAGATTTATTT 1479
||||||||.||.||||||||..|||||||..|||||||||||||.||.|.|||||||||..|.||.
Sbjct 1351 --------AGTTCCAGCTCAAGTCCTAGCCCCAGTTCAAGTGGTGAAAGTTCCGAGAGTAGCTCAGAGATGTTC 1416
Query 1480 GAAGGCAGTAATGAAGGAAGCTCATCATCAGGCTCATCAGGTGCCAGGCGAGAGGGTCGACATAGGGCCCCAGT 1553
||||||||||.|||||||.|| ||.||.|||.||| ||||..||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 GAAGGCAGTAGTGAAGGAGGC---TCGTCTGGCCCAT------CCAGAAGAGATGGTCGACATAGGGCCCCAGT 1481
Query 1554 CACATTTGATGAAAGTGGCTCTTTGCCCTTCCTTAGCCTGGCTCAGTTTTTCCTCTTAAATGAGGATGATGATG 1627
||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1482 CACATTTGATGAAAGTGGCTCTCTGCCATTCCTTAGTCTGGCTCAGTTTTTTCTTTTAAATGAAGATGATGAAG 1555
Query 1628 ACCAACCTAGAGGACTCACCAAAGAACAGATTGACAACTTGGCAATGAGAAGTTTTGGTGAAAATGATGCATTA 1701
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1556 ACCAACCTAGAGGACTCACTAAAGAACAGATCGATAACTTGGCAATGAGAAGCTTTGGTGAAAATGATGCATTG 1629
Query 1702 AAAACCTGTAGTGTTTGCATTACAGAATATACAGAAGGCAACAAACTTCGTAAACTACCTTGTTCCCATGAGTA 1775
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1630 AAAACGTGTAGTGTTTGCATTACAGAATACACAGAAGGCAACAAACTTCGTAAACTACCTTGCTCCCATGAGTA 1703
Query 1776 CCATGTCCACTGCATCGATCGCTGGTTATCTGAGAATTCTACCTGTCCTATTTGTCGCAGAGCAGTCTTAGCTT 1849
|||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1704 CCACGTCCACTGCATCGACCGCTGGTTGTCTGAGAATTCCACCTGTCCCATTTGTCGCAGGGCAGTCTTATCTT 1777
Query 1850 CTGGTAACAGAGAAAGTGTTGTG 1872
||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1778 CTGGGAACAGAGAAAGTGTTGTG 1800