Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03238
- Subject:
- XM_006501930.2
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 1065
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT 74
||||||||||.|...||||.|||||| |.||||..|||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGAAGAAGAGCGGCTCCGGCAAGCG------------------------GTCTGCGGCGCCCGAGAAGGT 47
Query 75 CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG 121
Query 149 GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC 222
|.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 122 GCGACCAGCTCTACGTCTCCGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAACAGTCAGGAGGTGTTTGACCTGAGTGAC 195
Query 223 TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA 296
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.
Sbjct 196 TATGAGAAGTGCGAAGAGCTCCGGAAATCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCACAGCAAGTTCACCCTGGCCCG 269
Query 297 CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA 370
.|.||.||||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 270 GTGCAGACAGCCGGGCACCACGGCACCCAACCTCATCTTCCTGGCCGTGAGTCCTGAAGAGAAGGAGTCATGGA 343
Query 371 TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC 444
||||.|||||.|..||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 TCAACGCCCTGAGTTCTGCCATTACCAGAGCTAAAAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC 417
Query 445 TATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGACACCTAAT 518
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 418 TATCTTGCCCACCCTACTCGAGACAGAGCAAAAATCCAACACTCCCGCCGTCCTCCAACCCGGGGACACCTCAT 491
Query 519 GGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG 592
||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 GGCTGTGGCTTCGACCTCTACCTCAGATGGGATGCTAACATTAGACCTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG 565
Query 593 AGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGGGAGCCGG 666
||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 566 AGGAGCCAGCCTCTTGTGCTGAGAGCTTCCGGGTCGATCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCTGGCAGTCGA 639
Query 667 CGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTC--CGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGGAAAAA 738
||||||||||||||||||.|.||||||||||| ||||| |||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 640 CGGAGAGCGGACTCAGACAGGATCCAGCCCTCTTCGCAG--CGGGCAAGCAGCCTTTCTCGGCCTTGGGAAAAA 711
Query 739 ACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCC----ACAGAGAAAGGCCGCTGCG 808
.|||||||.||.|||.||||||||||.||.||||..|||||||| ||| ||||||||..||||.||.|
Sbjct 712 CCAGACAAGGGAGCCCCCTACACCCCACAAGCACTGAAGAAGTT----CCCCAGTACAGAGAAGAGCCGATGTG 781
Query 809 CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACCC 882
||||||||||||||||||||||.|||.||||..|||||.|.||||||.||||.||.||.|..|||||||||.||
Sbjct 782 CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCCCAGAGGGACACTGCCCCAGCCCGCCCCCTTCACCTTCAAGCTGAGGAATCC 855
Query 883 CCAACCCCTG-CCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA 955
|.|.|||||| ||||.||| |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 856 CTACCCCCTGTCCCTGCCC-AGCCAGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGAAGA 928
Query 956 CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG 1029
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||.
Sbjct 929 CTCAGGAGCTGCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGTGACGGCAAGCGGAAGGCCAAGGACCCCCCACAGTCTCCA 1002
Query 1030 CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA 1103
||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1003 CCCGACTCGGAGTCGGAGCAGCTGCTGCTGGAGACAGAGAGGCTGCTGGGAGAGGCTTCCTCCAACTGGAGCCA 1076
Query 1104 GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 1177
|||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 GGCAAAGAGAGTGCTGCAGGAAGTCCGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGGCAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 1150
Query 1178 CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG 1227
|||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1151 CCCACCTCAGACAGACCTCCCAGCACAGTCAATACCGGAAGAGCCTGATG 1200