Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03381
- Subject:
- XM_017024756.1
- Aligned Length:
- 1344
- Identities:
- 1116
- Gaps:
- 228
Alignment
Query 1 ATGAGCTCGCGGAAGCTGAGCGGGCCGAAAGGCAGGAGGCTCAGCATACACGTCGTGACTTGGAACGTGGCTTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGCAGCGCCCCCTCTAGATCTCAGTGACCTGCTTCAGCTGAACAACCGGAACCTCAATCTTGACATATATGTTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTGGTTTGCAGGAATTGAACTCTGGGATCATAAGCCTCCTTTCCGATGCTGCCTTTAATGACTCGTGGAGCAGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCCTCATGGATGTGCTTTCCCCTCTGAGCTTCATCAAGGTCTCCCATGTCCGTATGCAGGGGATCCTCTTACT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------ATGGATGTGCTTTCCCCTCTGAGCTTCATCAAGGTCTCCCATGTCCGTATGCAGGGGATCCTCTTACT 68
Query 297 GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 GGTCTTTGCCAAGTATCAGCATTTGCCCTATATCCAGATTCTGTCTACTAAATCCACCCCCACTGGCCTGTTTG 142
Query 371 GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143 GGTACTGGGGGAACAAAGGTGGAGTCAACATCTGCCTGAAGCTTTATGGCTACTATGTCAGCATCATCAACTGC 216
Query 445 CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 CACCTGCCTCCCCACATTTCCAACAATTACCAGCGGCTGGAGCACTTTGACCGGATCCTGGAGATGCAGAATTG 290
Query 519 TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 TGAGGGGCGAGACATCCCAAACATCCTGGACCACGACCTCATTATCTGGTTTGGAGACATGAACTTTCGGATCG 364
Query 593 AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGGACTTTGGGTTGCACTTTGTTCGGGAATCCATTAAAAATCGGTGCTACGGTGGCCTGTGGGAGAAGGACCAG 438
Query 667 CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CTCAGCATTGCCAAGAAACATGACCCGCTGCTCCGGGAGTTCCAGGAGGGCCGCCTACTCTTCCCGCCCACCTA 512
Query 741 CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 CAAGTTTGATAGGAACTCCAACGACTATGACACCAGTGAGAAAAAACGCAAGCCTGCATGGACCGATCGCATCC 586
Query 815 TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 TGTGGAGGCTGAAGCGGCAGCCCTGTGCTGGCCCCGACACTCCCATACCGCCGGCGTCACACTTCTCCTTGTCT 660
Query 889 CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTGAGGGGCTACAGCAGCCACATGACGTACGGCATCAGCGACCACAAGCCTGTCTCCGGCACGTTCGACTTGGA 734
Query 963 GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GCTGAAGCCATTGGTGTCTGCTCCGCTGATCGTCCTGATGCCCGAGGACCTGTGGACCGTGGAAAATGACATGA 808
Query 1037 TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TGGTCAGCTACTCTTCAACCTCGGACTTCCCCAGCAGCCCGTGGGACTGGATTGGACTGTACAAGGTGGGGCTG 882
Query 1111 CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CGGGACGTTAATGACTACGTGTCCTATGCCTGGGTCGGGGACAGCAAGGTCTCCTGCAGCGACAACCTGAACCA 956
Query 1185 GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 GGTTTACATCGACATCAGCAATATCCCTACCACTGAAGATGAGTTTCTCCTCTGTTACTACAGCAACAGTCTGC 1030
Query 1259 GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GTTCTGTGGTGGGGATAAGCAGACCCTTCCAGATCCCGCCTGGCTCCTTGAGGGAGGACCCACTGGGTGAAGCA 1104
Query 1333 CAGCCACAGATC 1344
||||||||||||
Sbjct 1105 CAGCCACAGATC 1116