Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03395
• Subject: XM_011512910.3
• Aligned Length: 976
• Identities: 895
• Gaps: 71

Alignment

Query   1  ATGCAGACTTTCACAATGGTTCTAGAAGAAATCTGGACAAGTC------TTTTCATGTGG--TTTTTCT-----  61
                          |||     ||||||     ||| |||.|      |||||...|.|  .||||||     
Sbjct   1  ---------------ATG-----AGAAGA-----GGA-AAGCCCAGCATTTTTCGACTTGACATTTTCTTCAAT  48

Query  62  -ACGC-------------ATTGATTC---------CATGTTT------GCTC-ACAGATGAAGTGGCCATTCTG  105
            ||||             |||  |||         |.|||||      |.|| ..|||||||||||||||||||
Sbjct  49  GACGCCCGTCTTATAAGTATT--TTCTTGAAAACTCCTGTTTTAAATAGATCTGGAGATGAAGTGGCCATTCTG  120

Query 106  CCTGCCCCTCAGAACCTCTCTGTACTCTCAACCAACATGAAGCATCTCTTGATGTGGAGCCCAGTGATCGCGCC  179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121  CCTGCCCCTCAGAACCTCTCTGTACTCTCAACCAACATGAAGCATCTCTTGATGTGGAGCCCAGTGATCGCGCC  194

Query 180  TGGAGAAACAGTGTACTATTCTGTCGAATACCAGGGGGAGTACGAGAGCCTGTACACGAGCCACATCTGGATCC  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195  TGGAGAAACAGTGTACTATTCTGTCGAATACCAGGGGGAGTACGAGAGCCTGTACACGAGCCACATCTGGATCC  268

Query 254  CCAGCAGCTGGTGCTCACTCACTGAAGGTCCTGAGTGTGATGTCACTGATGACATCACGGCCACTGTGCCATAC  327
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269  CCAGCAGCTGGTGCTCACTCACTGAAGGTCCTGAGTGTGATGTCACTGATGACATCACGGCCACTGTGCCATAC  342

Query 328  AACCTTCGTGTCAGGGCCACATTGGGCTCACAGACCTCAGCCTGGAGCATCCTGAAGCATCCCTTTAATAGAAA  401
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343  AACCTTCGTGTCAGGGCCACATTGGGCTCACAGACCTCAGCCTGGAGCATCCTGAAGCATCCCTTTAATAGAAA  416

Query 402  CTCAACCATCCTTACCCGACCTGGGATGGAGATCACCAAAGATGGCTTCCACCTGGTTATTGAGCTGGAGGACC  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417  CTCAACCATCCTTACCCGACCTGGGATGGAGATCACCAAAGATGGCTTCCACCTGGTTATTGAGCTGGAGGACC  490

Query 476  TGGGGCCCCAGTTTGAGTTCCTTGTGGCCTACTGGAGGAGGGAGCCTGGTGCCGAGGAACATGTCAAAATGGTG  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491  TGGGGCCCCAGTTTGAGTTCCTTGTGGCCTACTGGAGGAGGGAGCCTGGTGCCGAGGAACATGTCAAAATGGTG  564

Query 550  AGGAGTGGGGGTATTCCAGTGCACCTAGAAACCATGGAGCCAGGGGCTGCATACTGTGTGAAGGCCCAGACATT  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565  AGGAGTGGGGGTATTCCAGTGCACCTAGAAACCATGGAGCCAGGGGCTGCATACTGTGTGAAGGCCCAGACATT  638

Query 624  CGTGAAGGCCATTGGGAGGTACAGCGCCTTCAGCCAGACAGAATGTGTGGAGGTGCAAGGAGAGGCCATTCCCC  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639  CGTGAAGGCCATTGGGAGGTACAGCGCCTTCAGCCAGACAGAATGTGTGGAGGTGCAAGGAGAGGCCATTCCCC  712

Query 698  TGGTACTGGCCCTGTTTGCCTTTGTTGGCTTCATGCTGATCCTTGTGGTCGTGCCACTGTTCGTCTGGAAAATG  771
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713  TGGTACTGGCCCTGTTTGCCTTTGTTGGCTTCATGCTGATCCTTGTGGTCGTGCCACTGTTCGTCTGGAAAATG  786

Query 772  GGCCGGCTGCTCCAGTACTCCTGTTGCCCCGTGGTGGTCCTCCCAGACACCTTGAAAATAACCAATTCACCCCA  845
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787  GGCCGGCTGCTCCAGTACTCCTGTTGCCCCGTGGTGGTCCTCCCAGACACCTTGAAAATAACCAATTCACCCCA  860

Query 846  GAAGTTAATCAGCTGCAGAAGGGAGGAGGTGGATGCCTGTGCCACGGCTGTGATGTCTCCTGAGGAACTCCTCA  919
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861  GAAGTTAATCAGCTGCAGAAGGGAGGAGGTGGATGCCTGTGCCACGGCTGTGATGTCTCCTGAGGAACTCCTCA  934

Query 920  GGGCCTGGATCTCA  933
           ||||||||||||||
Sbjct 935  GGGCCTGGATCTCA  948