Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03431
- Subject:
- NM_001330112.2
- Aligned Length:
- 2712
- Identities:
- 2505
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA 74
Query 75 CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC 148
Query 149 TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT 222
Query 223 GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC 296
Query 297 ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG 370
Query 371 GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA 444
Query 445 GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA 518
Query 519 ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT 592
Query 593 GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA 666
Query 667 AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC 740
Query 741 CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA 814
Query 815 TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT 888
Query 889 ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA 962
Query 963 AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG 1036
Query 1037 AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC 1110
Query 1111 TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT 1184
Query 1185 CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG 1258
Query 1259 TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT 1332
Query 1333 TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT 1406
Query 1407 GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT 1480
Query 1481 TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATT 1554
Query 1555 GGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGA 1628
Query 1629 AGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACC 1702
Query 1703 TCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCT 1776
Query 1777 GATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGG 1850
Query 1851 ACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTC 1924
Query 1925 CTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAA------------------------------------- 1961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGTTATATTTGGGAATTTAAATATCTTTTTGTTCAG 1998
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 1999 TGCAATTACACACTAGAAAACCTAGAATTGCATACAACGCCTTGGTCATCCTGTGAGTGCTTGTTTGATGATGA 2072
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 2073 TATAAGGGCAATTACATTTAAAGCAAAATTTCAAAAAAGTGCACCCTCCTTTGTGAAGATATCAGACTTAGCAA 2146
Query 1962 ----------------------AGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTTCCTATTACA 2013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCCACCTAGAGGATAAGTGTTCAGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTTCCTATTACA 2220
Query 2014 GCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATA 2087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATA 2294
Query 2088 TACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCT 2161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCT 2368
Query 2162 TGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACATGATGTTTGT 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACATGATGTTTGT 2442
Query 2236 ATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGT 2309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGT 2516
Query 2310 TCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAAC 2383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAAC 2590
Query 2384 CTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGATTTCTCCCTC 2457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGATTTCTCCCTC 2664
Query 2458 CTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2712