Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03431
- Subject:
- NR_027634.1
- Aligned Length:
- 3298
- Identities:
- 2466
- Gaps:
- 797
Alignment
Query 1 -------ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTAT 67
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 AGAAATCATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAGTTGCTCCACTGAAAATGACAGTAT 74
Query 68 CAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCT 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCT 148
Query 142 TTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGA 215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 149 TTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATGAAGTCCCAGATTCTATTGGTTCTCCAGA 222
Query 216 TCTTAGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTT 289
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTTTGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTT 296
Query 290 CTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAA 363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGGCATAACTAGCTCTAATATGCAA 370
Query 364 ATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAA 437
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTAACCGAAGAAGAAAAGTATC-AAAGCTTCTCAGTGAAAATAA 443
Query 438 AATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGG 511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTCAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGG 517
Query 512 GCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAA 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAA 591
Query 586 AGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 592 AGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGCGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACTCAGTAGA 665
Query 660 TAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTA 733
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 666 TAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAAGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATAAAGAATTTCTCAGTA 739
Query 734 TAATTACCTCCAGCCAGGTTGC-TTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAA 806
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TAATTACCTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAA 813
Query 807 TGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTG 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTG 887
Query 881 ATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 ATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCT 961
Query 955 AAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTT 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTT 1035
Query 1029 CAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAAC 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAAC 1109
Query 1103 TAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTA 1176
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1110 TAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGCCCAGTCTGAAGCTCTA 1183
Query 1177 TCTAGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TCTAGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCG 1257
Query 1251 GAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGT 1324
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAA--ATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGT 1329
Query 1325 ATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGC 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 ATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGC 1403
Query 1399 TCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGAC 1472
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 TCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAAGTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGAC 1477
Query 1473 TGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACC 1546
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACGGATGTTGTTATTCATGAGGACC 1551
Query 1547 AATGGATTGGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATT 1620
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AATGGATTGGTGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATT 1625
Query 1621 CAGCCTGAAGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACA 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CAGCCTGAAGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGACGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACA 1699
Query 1695 TTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACC 1768
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGACAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACC 1773
Query 1769 TTCAACCTGATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGT 1842
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TTCAACCTGATGTGTTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTC-CTATACTGACAGAGGCAGTATACAGT 1846
Query 1843 TATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATT 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 TATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATT 1920
Query 1917 ATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTT 1990
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1921 ATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGAGTGGTTCTAATTAAAGCCCAGATTT 1994
Query 1991 CAGAGCTGGCATTTCCTATTACAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTT 2064
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 CAGAGCTGGCATTTCCTCTTACAGCAGCTCAGAAGATATCTCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTT 2068
Query 2065 TCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGAT 2138
||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 TCTTCTCTTCCCAACATCATATATACTGGCTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGAT 2142
Query 2139 CTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCA 2212
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2143 CTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCG 2216
Query 2213 TTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCA 2286
||||||||||||||.||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 TTGATGGAAGACATAATGTTTACATCCATGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCA 2290
Query 2287 GACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTC 2360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTTGTGGCAGACCTGTTCCACTC 2364
Query 2361 CTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATC 2434
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 CTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTGAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATC 2438
Query 2435 CATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC--- 2505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 CATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATGGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTCTGA 2512
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2513 GGCCAGAGGAAGAAATTGCAGGCATTTCAAGGAAGAAGTACTGAAATGATTTGTCTTTTGAAATAAATGAATGA 2586
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2587 CAGGGCTTTTGCTTTGGATTTTTTATGAAATATATTTTACAAAGAGAATTGCACTAGATATATAAATTAAAACT 2660
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2661 TTTTTCTAAGAAAATCCTGTGAGGTTTAAAAAGATTGTTTTTGTCTTTTGGTTTCTTCCTTTCTTCTGGAGAAA 2734
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2735 TGATCTACCAGTCAAGGCAATATGTAGCAGATCCCTGGGAATTAAAGGTTTGCCCATTTGTTCACTGTATTTAG 2808
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2809 TCCCTGCTACATTCCAGGCATCGTACTAAGTATGGGGAACCACAGAGAAGACACTCCTTCAGAAACTGCTGCAG 2882
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2883 TGCTTTCGCTTATCCCTACCTAAAAAACCGTCAATGTGAAATCATTTCCTTGATTATAACTATAATGATAATGG 2956
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 2957 ATTAGTTTATATAAACCTATGTTTAGACAAGTTCAAGACAAGCGTGTCTTTCTATAAAAAGTATTGAAAGTGAA 3030
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3031 GGAAATGAGATCATGTTTCAATTTATTAAAGCAGGGAAGAGCGTTCTGTGGTTAGTTCGTGTCTAGGATTTGAG 3104
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3105 TGCCTTACTGAATGTATTTACCAGCAAACATGTAGCAATCTGTTCTCTCATTGTGATTGTGGAAGAAGCTCATG 3178
Query 2506 -------------------------------------------------------------------------- 2505
Sbjct 3179 TAAAATGATAGTCATTAATGAGGAAGTATGGCGTGGTACTTATTCTGTAAGTTCAGAGTATGCTGAGTGTTAAT 3252
Query 2506 ------------------------------------------ 2505
Sbjct 3253 AGATTGTCATATTGCCTGAAAATAAATTCATGATGACATGAA 3294