Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03431
- Subject:
- XM_011539877.2
- Aligned Length:
- 2856
- Identities:
- 2505
- Gaps:
- 351
Alignment
Query 1 ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA 74
Query 75 CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC 148
Query 149 TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT 222
Query 223 GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC 296
Query 297 ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG 370
Query 371 GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA 444
Query 445 GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA 518
Query 519 ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT 592
Query 593 GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA 666
Query 667 AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC 740
Query 741 CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA 814
Query 815 TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT 888
Query 889 ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA 962
Query 963 AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG 1036
Query 1037 AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC 1110
Query 1111 TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT 1184
Query 1185 CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG 1258
Query 1259 TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT 1332
Query 1333 TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT 1406
Query 1407 GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT 1480
Query 1481 TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAG----------------------------- 1525
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGTCCTAGCTTTCAGAATGCTCTCCTTGAAA 1554
Query 1526 -------------------------------------------------------------------------- 1525
Sbjct 1555 TTTCTCGTCTGTTCCTTTTTTCTGAAGAACATGCATCCTGAATGTTGGATCATGAAAAGTCTTGAATGCTGTAC 1628
Query 1526 -----------------------------------------ATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATTGGCG 1558
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TAGCTCTTCCTGGCTAGGCAGTGGGGAACCACTGTTTTTTAATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATTGGCG 1702
Query 1559 AGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGAAGAA 1632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGAAGAA 1776
Query 1633 TATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACCTCAG 1706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACCTCAG 1850
Query 1707 AGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCTGATG 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCTGATG 1924
Query 1781 TATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGGACAG 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGGACAG 1998
Query 1855 AAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTCCTGG 1928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTCCTGG 2072
Query 1929 AGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAA----------------------------------------- 1961
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGTTATATTTGGGAATTTAAATATCTTTTTGTTCAGTGCA 2146
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 2147 ATTACACACTAGAAAACCTAGAATTGCATACAACGCCTTGGTCATCCTGTGAGTGCTTGTTTGATGATGATATA 2220
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 2221 AGGGCAATTACATTTAAAGCAAAATTTCAAAAAAGTGCACCCTCCTTTGTGAAGATATCAGACTTAGCAACCCA 2294
Query 1962 ------------------AGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTTCCTATTACAGCAT 2017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCTAGAGGATAAGTGTTCAGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTTCCTATTACAGCAT 2368
Query 2018 CTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACT 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACT 2442
Query 2092 GGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCC 2165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCC 2516
Query 2166 ATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCC 2239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCC 2590
Query 2240 GTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCT 2313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCT 2664
Query 2314 TCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTG 2387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTG 2738
Query 2388 TGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGG 2461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGG 2812
Query 2462 ATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2856