Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03431
- Subject:
- XM_017016349.1
- Aligned Length:
- 2943
- Identities:
- 2505
- Gaps:
- 438
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATTTGGCTGGAGTTATGATGTCGTGCAAGCGCTATCTGTTACCAGTTCCTGAGCCTTTTGAGGATTCTGT 74
Query 1 -------------ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCA 61
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACGAAGAAATCATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCA 148
Query 62 CAGTATCAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAA 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGTATCAGAAGACACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAA 222
Query 136 CATTCTTTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTC 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATTCTTTATATCTGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTC 296
Query 210 TCCAGATCTTAGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTT 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCAGATCTTAGTGGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTT 370
Query 284 CTGTTTCTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAAT 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGTTTCTGAAACACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAAT 444
Query 358 ATGCAAATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGA 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGCAAATATGTGGATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGA 518
Query 432 AAATAAAATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTC 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAATAAAATTAGAGATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTC 592
Query 506 AGTTGGGCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTG 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTTGGGCCATAAATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTG 666
Query 580 GTACAAAGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTACAAAGAGAGTGTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGC 740
Query 654 AGTAGATAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTC 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTAGATAAGTCAAGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTC 814
Query 728 TCAGTATAATTACCTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAA 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCAGTATAATTACCTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAA 888
Query 802 GGGAATGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCA 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGAATGTAAACATGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCA 962
Query 876 GCTTGATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTT 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTTGATGGTTTTACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTT 1036
Query 950 GTCCTAAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAA 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTCCTAAAACAGAAAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAA 1110
Query 1024 CTTTTCAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTC 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTTTCAGTTCTGAAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTC 1184
Query 1098 CCAACTAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAG 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAACTAAATACCTTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAG 1258
Query 1172 CTCTATCTAGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATG 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCTATCTAGAGTCCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATG 1332
Query 1246 GATCGGAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATCGGAGAAATGTGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCA 1406
Query 1320 GAAGTATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATT 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAGTATAATTGTTTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATT 1480
Query 1394 CTGGCTCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGG 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGGCTCTAAAGTGCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGG 1554
Query 1468 AGGACTGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAG---------------- 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGGACTGCAGCATTTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGTCCTAGCTTTCAGAAT 1628
Query 1526 -------------------------------------------------------------------------- 1525
Sbjct 1629 GCTCTCCTTGAAATTTCTCGTCTGTTCCTTTTTTCTGAAGAACATGCATCCTGAATGTTGGATCATGAAAAGTC 1702
Query 1526 ------------------------------------------------------ATGTTGTTATTCATGAGGAC 1545
||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGAATGCTGTACTAGCTCTTCCTGGCTAGGCAGTGGGGAACCACTGTTTTTTAATGTTGTTATTCATGAGGAC 1776
Query 1546 CAATGGATTGGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTAT 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAATGGATTGGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTAT 1850
Query 1620 TCAGCCTGAAGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAAC 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCAGCCTGAAGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAAC 1924
Query 1694 ATTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCAC 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATTCCTACCTCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCAC 1998
Query 1768 CTTCAACCTGATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAG 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTTCAACCTGATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAG 2072
Query 1842 TTATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTAT 1915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTATAGAGGACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTAT 2146
Query 1916 TATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAA---------------------------- 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TATGGGGTCCTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGTTATATTTGGGAATTTAAATATCTT 2220
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 2221 TTTGTTCAGTGCAATTACACACTAGAAAACCTAGAATTGCATACAACGCCTTGGTCATCCTGTGAGTGCTTGTT 2294
Query 1962 -------------------------------------------------------------------------- 1961
Sbjct 2295 TGATGATGATATAAGGGCAATTACATTTAAAGCAAAATTTCAAAAAAGTGCACCCTCCTTTGTGAAGATATCAG 2368
Query 1962 -------------------------------AGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTT 2004
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACTTAGCAACCCACCTAGAGGATAAGTGTTCAGGAGTGGTTCTGATTAAAGCCCAGATTTCAGAGCTGGCATTT 2442
Query 2005 CCTATTACAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAA 2078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCTATTACAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTTTTTCTTCTCTTCCCAA 2516
Query 2079 CATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTT 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGGATCTACAAACAATGTT 2590
Query 2153 TTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACAT 2226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGCCATTGATGGAAGACAT 2664
Query 2227 GATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAG 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTGCAGACTGCCTCAACAG 2738
Query 2301 AGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCA 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCACTCCTTGTTGGCAGTCA 2812
Query 2375 GCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGAT 2448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTATCCATTACAACAAGAT 2886
Query 2449 TTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC 2943