Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03431
• Subject: XM_017016352.2
• Aligned Length: 2663
• Identities: 2496
• Gaps: 160

Alignment

Query    1  ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGGAGGATCTCAAGTCCACATTTTTTGGGGTGCTCCAATTGCTCCACTGAAAATCACAGTATCAGAAGA  74

Query   75  CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACAGCTTCTTTAATGTCTGTTGCTGACCCCTGGAAAAAAATTCAGCTTTTATACAGTCAACATTCTTTATATC  148

Query  149  TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGGATGAAAAACAGCACAAAAATCTTGAAAACTATAAAGTCCCAGAATCTATTGGTTCTCCAGATCTTAGT  222

Query  223  GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTCATTTCTTAGCAAACTGTATGAATAGACATGTTCATGTGAAAGATGACTTTGTACGTTCTGTTTCTGAAAC  296

Query  297  ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGAATATAGAATCCCAGAAGATTCACTCCTCTAGACTGAGTGATATAACTAGCTCTAATATGCAAATATGTG  370

Query  371  GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GATTTAAAAGCACAGTTCCGCATTTCACCGAAGAAGAAAAGTATCAAAAGCTTCTCAGTGAAAATAAAATTAGA  444

Query  445  GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGAACAGCCTAAACATCAGCCAGATATATGTGGTAAGAACTTTAACACAAATTTGTTTCAGTTGGGCCATAA  518

Query  519  ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGTGCAGCTGTGTTGGATTTGGTTTGTAGTACTGAAAAAATTAATATAGGGCCTGAAGTGGTACAAAGAGAGT  592

Query  593  GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGCCAACAGAATATCATGAAATACAAAACCAGTGTTTGGGATTATTTTCCTCGAACGCAGTAGATAAGTCA  666

Query  667  AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGTCTGAAGCAGCAGTTAGGAAGGTCTCAGACCTTAAAATATCAACTGATACAGAATTTCTCAGTATAATTAC  740

Query  741  CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGCCAGGTTGCTTTTTTAGCTCAAAAGAAAGATAAAAGGCGGAGTCCTGTAAATAAAGGGAATGTAAACA  814

Query  815  TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGACTGAACCAAAGGCAAGTTACGGGGAGATAAGAATACCTGAAGAGAATTCGATTCAGCTTGATGGTTTT  888

Query  889  ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGAAGCATATGAAAGTGGACAAAACCAAGCATATTCCCTTGAACTTTTTAGTCCTGTTTGTCCTAAAACAGA  962

Query  963  AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAATAGCCGCATTCACATAAACTCTGATAAAGGTCTTGAAGAACATACAGGATCTCAAGAACTTTTCAGTTCTG  1036

Query 1037  AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGATGAACTGCCACCAAATGAGATACGTATTGAGTTGTGTAGCTCAGGAATACTGTGTTCCCAACTAAATACC  1110

Query 1111  TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCACAAAAGTGCTATTAAAAGAAGCTGTACCTCTGAAGATAAAGTGGGCCAGTCTGAAGCTCTATCTAGAGT  1184

Query 1185  CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTTCAAGTAGCTAAGAAAATGAAGTTGATTTCTAATGGAGGAGATTCTGCTGTAGAAATGGATCGGAGAAATG  1258

Query 1259  TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTCTGAATTTAAGAGTATTAAAAAAACATCATTAATAAAAAACTGTGATTCTAAAAGCCAGAAGTATAATTGT  1332

Query 1333  TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAGTCATGGTGCTATCTCCATGCCATGTGAAGGAAATAAACATAAAATTCGGACCAAATTCTGGCTCTAAAGT  1406

Query 1407  GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCTTTAGCAACAGTTACAGTAATTGATCAATCAGAAACTAAGAAGAAGGTTTTTCTGTGGAGGACTGCAGCAT  1480

Query 1481  TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTGGGCATTTACAGTGTTTCTTGGAGATATAATTTTACTCACAGATGTTGTTATTCATGAGGACCAATGGATT  1554

Query 1555  GGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCGAGACAGTACTACAATCAACATTTAGCAGTCAGTTATTAAATCTTGGGAGTTATTCATCTATTCAGCCTGA  1628

Query 1629  AGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAATATTCCAGTGTAGTTAGTGAAGTTGTACTTCAAGACTTACTGGCATATGTGTCCTCAAAACATTCCTACC  1702

Query 1703  TCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCAGAGATCTTCCTCCGAGGCAGCCTCAGAGGGTGAACAGTATAGACTTTGTAGAATTGGAGCACCTTCAACCT  1776

Query 1777  GATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGTATTAGTCCACGCAGTACTAAGAGTTGTTGATTTCACTATACTGACAGAGGCAGTATACAGTTATAGAGG  1850

Query 1851  ACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACAGAAGCAGAAAAAAGTTATGTTAACAGTGGAACAGGCCCAAGATCAACATTATGCGCTTGTATTATGGGGTC  1924

Query 1925  CTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGG--------------------------------AG  1966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                ||
Sbjct 1925  CTGGAGCAGCCTGGTACCCTCAACTTCAAAGGAAAAAAGGTTATATTTGGGAATTTAAATATCTTTTTGTTCAG  1998

Query 1967  TG------------------------------------------------------------GTTCTGA-----  1975
            ||                                                            ||| |||     
Sbjct 1999  TGCAATTACACACTAGAAAACCTAGAATTGCATACAACGCCTTGGTCATCCTGTGAGTGCTTGTT-TGATGATG  2071

Query 1976  ------------------TTAAAGC-------------------CC-----------AGATTTCAGAGCTGGCA  2001
                              |||||||                   ||           ||||.|||||..|.|||
Sbjct 2072  ATATAAGGGCAATTACATTTAAAGCAAAATTTCAAAAAAGTGCACCCTCCTTTGTGAAGATATCAGACTTAGCA  2145

Query 2002  --TTTCCTA-----------TTACAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTT  2062
              ...||||           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  ACCCACCTAGAGGATAAGTGTT-CAGCATCTCAGAAGATAGCGCTAAATGCTCACAGTTCTCTGAAGAGTATTT  2218

Query 2063  TTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGG  2136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219  TTTCTTCTCTTCCCAACATCGTATATACTGGTTGTGCAAAATGTGGATTGGAACTAGAAACAGATGAGAACAGG  2292

Query 2137  ATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGC  2210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293  ATCTACAAACAATGTTTTAGCTGCTTGCCATTTACTATGAAGAAAATATATTATAGGCCAGCGTTAATGACTGC  2366

Query 2211  CATTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTG  2284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367  CATTGATGGAAGACATGATGTTTGTATCCGTGTAGAATCAAAGCTGATAGAGAAGATTCTTCTCAACATTTCTG  2440

Query 2285  CAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCAC  2358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441  CAGACTGCCTCAACAGAGTGATAGTTCCTTCCTCAGAGATCACCTATGGGATGGTCGTGGCAGACCTGTTCCAC  2514

Query 2359  TCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTA  2432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515  TCCTTGTTGGCAGTCAGCGCAGAACCTTGTGTATTAAAGATTCAGAGCCTTTTTGTGTTAGATGAAAACAGCTA  2588

Query 2433  TCCATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC  2505
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589  TCCATTACAACAAGATTTCTCCCTCCTGGATTTTTATCCTGACATTGTAAAGCATGGAGCCAATGCCCGTCTC  2661