Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03436
• Subject: NM_027113.2
• Aligned Length: 996
• Identities: 842
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ATGGCAACCAAGGA---GTCA--AGAGACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTCATCGGCCAATCAGAGCAAG  69
           |||||.|||.||.|   |.||  ||||     |.||||||||     |.||.||| ||.|||...|.|.||.||
Sbjct   1  ATGGCGACCGAGCATCTGCCAGCAGAG-----AGAGCACAGT-----CACTTCTC-TCTGCCCCCCGGCGCGAG  63

Query  70  GAAGTGCCTGA-AAACCCAAACTATGCTCTCAAATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAGTGTCATCAGTTA  142
           ||||.|||..| |||||| |||||||||||||.|..||||||||.|||.|||.|||..||..|.||||||||||
Sbjct  64  GAAGAGCCGCAGAAACCC-AACTATGCTCTCAGACTTACTCTTGCGGGGCACTCGGCGGCCATATCATCAGTTA  136

Query 143  AGTTTAGTCCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAATTTGGGGAGCATATGAT  216
           |.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||...|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 137  AATTTAGTCCTAATGGCGAATGGCTAGCGAGTTCTGCAGCTGATGCACTAATTATAATTTGGGGAGCATACGAT  210

Query 217  GGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATTTGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATCAGATTCCAGTCG  290
           ||.||.|.|.|||||||||||||||||||.|.|.||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 211  GGGAATTGTAAGAAAACACTCTATGGTCACAGTCTGGAAATATCAGATGTTGCCTGGTCTTCAGATTCTAGTCG  284

Query 291  TCTTGTTTCTGCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATGTTTGAAAACACTGA  364
           |||.|||||.||||||||||||||.||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 285  TCTAGTTTCAGCCTCAGATGATAAGACTCTAAAGGTATGGGATATGAGATCTGGAAAATGTCTGAAAACACTGA  358

Query 365  AGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCAATCCGCCATCCAACCTTATAATCTCGGGATCTTTTGAT  438
           ||||||||||..|||..|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.||..|.|||||.|||||||||
Sbjct 359  AGGGGCACAGCGATTTCGTCTTCTGTTGTGACTTCAACCCACCATCCAACCTCATCGTTTCGGGCTCTTTTGAT  432

Query 439  GAGACTGTAAAAATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATTCTGACCCAGTTTC  512
           ||||.|||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..||||
Sbjct 433  GAGAGTGTGAAAATATGGGAAGTAAAAACAGGAAAATGCCTCAAGACTTTGTCTGCACATTCGGACCCCATTTC  506

Query 513  TGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGTCAGGTAGCTATGATGGCCTCTGTAGAATCTGGGATG  586
           |||.||..||||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 507  TGCCGTAAATTTTAATTGTAATGGGTCCTTGATAGTGTCCGGGAGCTATGATGGGCTTTGTAGAATTTGGGATG  580

Query 587  CTGCATCAGGTCAGTGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGTAAAATTTTCTCCA  660
           ||||.|||||.||||||||||..||.||.|.||||||.|..||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 581  CTGCGTCAGGCCAGTGTTTAAGGACACTTGCTGATGAAGGCAACCCTCCAGTGTCTTTTGTAAAATTTTCTCCA  654

Query 661  AATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTCTTAAACTATGGGATTATAGCAGAGGCAGGTGCCT  734
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 655  AATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAATACTCTTAAACTGTGGGATTACAGCAGGGGCAGATGCCT  728

Query 735  GAAAACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACTGGTGGAAAGTGGA  808
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.|||.||.|||||||||.||||||||.
Sbjct 729  GAAGACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATACTGCCTATTTGCCAGTTTCTCGGTTACTGGTAGAAAGTGGG  802

Query 809  TTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACCTTCAGACTAAAGAGATTGTGCAGAAATTACAA  882
           |||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||..||.|||
Sbjct 803  TTGTGTCTGGTTCAGAGGACAACATGGTTTACATCTGGAATCTTCAGACTAAAGAGATTGTACAGAGGTTGCAA  876

Query 883  GGCCATACAGATGTTGTGATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAGCAGCATTAGAAAA  956
           ||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 877  GGTCACACAGATGTGGTGATCTCAGCAGCCTGTCACCCTACAAAAAACATCATCGCATCAGCAGCACTAGAAAA  950

Query 957  TGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC  990
           ||||||.|||||||||.|||||..||||.||..|
Sbjct 951  TGACAAGACAATTAAAGTGTGGTCGAGTGACTGC  984