Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03436
- Subject:
- XM_024447393.1
- Aligned Length:
- 1009
- Identities:
- 806
- Gaps:
- 26
Alignment
Query 1 ATGGCAACCAAGGAGTCAAGA--------------GACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTCATCGGCCAAT 60
|||||.||..||||| |||| |.|||||.|||||||....|||..||.|||||.||||.|
Sbjct 1 ATGGCGACGGAGGAG--AAGAAGCCCGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCATCCGCCACT 72
Query 61 CAGAGCAAG----GAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCAAATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAG 130
||||||||| .| ||||..||.||||||||||||||.||.|..||.||||..||.|||||..||||||
Sbjct 73 CAGAGCAAGCCTACA----CCTGTGAAGCCAAACTATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAG 142
Query 131 TGTCATCAGTTAAGTTTAGTCCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAATTTGG 204
||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||..||.||.|.|||||||
Sbjct 143 TGTCCTCCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGG 216
Query 205 GGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATTTGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATC 278
||.||.||||||||.||||.|||||||||..|.|.||||||.||..|||.||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 217 GGCGCGTATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCTGGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTC 290
Query 279 AGATTCCAGTCGTCTTGTTTCTGCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATGTT 352
||||||.|..|.|||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.
Sbjct 291 AGATTCTAACCTTCTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGGACGTGAGCTCGGGCAAGTGTC 364
Query 353 TGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCAATCCGCCA-TCCAACCTTATAATCTC 425
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||| ||| |||||||||||..||||
Sbjct 365 TGAAAACCCTGAAGGGACACAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCC-CCAGTCCAACCTTATTGTCTC 437
Query 426 GGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAAATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATT 499
.|||||.|||||.||.|..||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct 438 AGGATCCTTTGACGAAAGCGTGAGGATATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCAGCTCACT 511
Query 500 CTGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGTCAGGTAGCTATGATGGCCTCTGT 573
|.||.|||||.||.||.||||||||||||.||..|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 512 CGGATCCAGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGTGATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCTGT 585
Query 574 AGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAGTGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGT 647
.|.||||||||..|.||.|||||.|||||..|.||.||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 586 CGCATCTGGGACACCGCCTCAGGCCAGTGCCTGAAGACGCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGT 659
Query 648 AAAATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTCTTAAACTATGGGATTATAGCA 721
.||.||.||.||.||.||.||||||||.||..|.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 660 GAAGTTCTCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGGACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCA 733
Query 722 GAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACT 795
..||.|.|||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 734 AGGGGAAGTGCCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGCATATTTGCCAATTTCTCTGTTACT 807
Query 796 GGTGGAAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACCTTCAGACTAAAGAGATTGT 869
|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 808 GGTGGGAAGTGGATTGTGTCTGGCTCAGAGGATAACCTTGTTTACATCTGGAACCTTCAGACGAAAGAGATTGT 881
Query 870 GCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTGATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAG 943
.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|
Sbjct 882 ACAGAAACTACAAGGCCACACAGATGTCGTGATCTCAACAGCTTGTCACCCAACAGAAAACATCATCGCCTCTG 955
Query 944 CAGCATTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC 990
|.||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct 956 CTGCGCTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGAAGAGTGACTGC 1002