Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03436
• Subject: XM_024447394.1
• Aligned Length: 1009
• Identities: 806
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCAACCAAGGAGTCAAGA--------------GACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTCATCGGCCAAT  60
            |||||.||..|||||  ||||              |.|||||.|||||||....|||..||.|||||.||||.|
Sbjct    1  ATGGCGACGGAGGAG--AAGAAGCCCGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCATCCGCCACT  72

Query   61  CAGAGCAAG----GAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCAAATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAG  130
            |||||||||    .|    ||||..||.||||||||||||||.||.|..||.||||..||.|||||..||||||
Sbjct   73  CAGAGCAAGCCTACA----CCTGTGAAGCCAAACTATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAG  142

Query  131  TGTCATCAGTTAAGTTTAGTCCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAATTTGG  204
            ||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||..||.||.|.|||||||
Sbjct  143  TGTCCTCCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGG  216

Query  205  GGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATTTGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATC  278
            ||.||.||||||||.||||.|||||||||..|.|.||||||.||..|||.||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  217  GGCGCGTATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCTGGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTC  290

Query  279  AGATTCCAGTCGTCTTGTTTCTGCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATGTT  352
            ||||||.|..|.|||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.
Sbjct  291  AGATTCTAACCTTCTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGGACGTGAGCTCGGGCAAGTGTC  364

Query  353  TGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCAATCCGCCA-TCCAACCTTATAATCTC  425
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||| ||| |||||||||||..||||
Sbjct  365  TGAAAACCCTGAAGGGACACAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCC-CCAGTCCAACCTTATTGTCTC  437

Query  426  GGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAAATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATT  499
            .|||||.|||||.||.|..||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct  438  AGGATCCTTTGACGAAAGCGTGAGGATATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCAGCTCACT  511

Query  500  CTGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGTCAGGTAGCTATGATGGCCTCTGT  573
            |.||.|||||.||.||.||||||||||||.||..|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||
Sbjct  512  CGGATCCAGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGTGATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCTGT  585

Query  574  AGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAGTGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGT  647
            .|.||||||||..|.||.|||||.|||||..|.||.||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  586  CGCATCTGGGACACCGCCTCAGGCCAGTGCCTGAAGACGCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGT  659

Query  648  AAAATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTCTTAAACTATGGGATTATAGCA  721
            .||.||.||.||.||.||.||||||||.||..|.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  660  GAAGTTCTCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGGACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCA  733

Query  722  GAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACT  795
            ..||.|.|||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  734  AGGGGAAGTGCCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGCATATTTGCCAATTTCTCTGTTACT  807

Query  796  GGTGGAAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACCTTCAGACTAAAGAGATTGT  869
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  808  GGTGGGAAGTGGATTGTGTCTGGCTCAGAGGATAACCTTGTTTACATCTGGAACCTTCAGACGAAAGAGATTGT  881

Query  870  GCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTGATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAG  943
            .||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|
Sbjct  882  ACAGAAACTACAAGGCCACACAGATGTCGTGATCTCAACAGCTTGTCACCCAACAGAAAACATCATCGCCTCTG  955

Query  944  CAGCATTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC  990
            |.||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct  956  CTGCGCTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGAAGAGTGACTGC  1002