Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03449
• Subject: NM_183188.2
• Aligned Length: 1307
• Identities: 1027
• Gaps: 178

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTCC  74
            |||.|||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGTTGGCGTCGCAAGGAGTCCTTCTGCATTCTTATGGCGTGCCCATGATTGTGCCTGCTGCCCCCTACTTCCC  74

Query   75  TGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct   75  GGGACTGATGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAGT  148

Query  149  TTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGC  222
            |.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGGC  222

Query  223  CAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGA  296
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||   .||.||
Sbjct  223  CAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTGA  293

Query  297  CACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGA  370
            |||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  294  CACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAGA  367

Query  371  CACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTC  444
            |||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||
Sbjct  368  CACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTTC  441

Query  445  CGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  518
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  CGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  515

Query  519  AGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACG  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  516  AGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCACG  589

Query  593  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTC  666
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  590  GTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGTC  663

Query  667  AACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCAC  740
            |||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  664  AACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCAC  737

Query  741  GGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  814
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  811

Query  815  CAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGT  888
            |||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  812  CAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGGT  885

Query  889  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  886  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATCA  959

Query  963  AGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCA  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  960  AGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCCA  1033

Query 1037  CTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCA  1110
            |||||||||||||||||||                                                     ||
Sbjct 1034  CTGCCGCTGCCTACAGTGA-----------------------------------------------------CA  1054

Query 1111  GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055  GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC  1128

Query 1185  A-------------------------------------------------------------------------  1185
            |                                                                         
Sbjct 1129  ATGAATGCTTTTGCGCCCTTGACCGATGCCAAGACTAGGAGCCATGCTGATGATGTGGGTCTCGTTCTTTCTTC  1202

Query 1186  -------------------------------------------------  1185
                                                             
Sbjct 1203  ATTGCAGGCTAGTATATACCGAGGGGGATACAACCGTTTTGCTCCATAT  1251