Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_006522173.3
- Aligned Length:
- 1396
- Identities:
- 1061
- Gaps:
- 230
Alignment
Query 1 -----ATGCTGGCGTCTCAA-----------GGAGTTCTCCTGC-----ATCCTTATGGCG--TGCCTATGATT 51
||.|||||..|| || ||||.|..|||.| ||| .|.|||| | ||.||.|.|
Sbjct 1 ATGAAATCCTGGCAGCT-AATTGCAGTCGTGGGAGATGCCCTTCAGGATATC--AAAGGCGACT-CCAATAACT 70
Query 52 GTACCG-GCAGCTCCTTACCTTCCTGGACTGA------TTCA-------------------------------- 86
| || |||| || ...||||.|| ||.|
Sbjct 71 G---CGCGCAG------AC---AGAGGACAGAAAGGTTTTGAGGCAACAGATGAATTGTGAAAGAGAGCAGCTG 132
Query 87 --GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCC 158
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 133 AGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAGTTCGCACCACC 206
Query 159 GCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGG 232
.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 207 CCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGGCCAGACCACTG 280
Query 233 TTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCT 306
|.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| .||.|||||.||.||.
Sbjct 281 TCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTGACACCAGTGCG 351
Query 307 CAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTC 380
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAGACACAACCTTC 425
Query 381 TGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGG 454
|||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.|
Sbjct 426 TGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTTCCGGGATCCAG 499
Query 455 ACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAG 528
|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 500 ACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCCAAG 573
Query 529 GGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGT 602
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 574 GGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCACGGTACCGTGGT 647
Query 603 AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATA 676
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 648 AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGTCAACCCCTACA 721
Query 677 CAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTG 750
|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 722 CCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCACGGTGCTGTTG 795
Query 751 TGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGG 824
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 796 TGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCTGG 869
Query 825 CTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGT 898
||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 870 CTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGGTCGCACCGTGT 943
Query 899 ACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTGTG 972
||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 944 ACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCAGTG 1017
Query 973 TATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGC 1046
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCCACTGCCGCTGC 1091
Query 1047 CTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACG 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACG 1165
Query 1121 AGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA--------- 1185
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 AGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCCCAAG 1239
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1240 GTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTGAGCA 1313
Query 1186 ---------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1314 TCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAAG 1377