Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_006522176.3
- Aligned Length:
- 1332
- Identities:
- 1079
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTCC 74
|||.|||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||.|.||
Sbjct 1 ATGTTGGCGTCGCAAGGAGTCCTTCTGCATTCTTATGGCGTGCCCATGATTGTGCCTGCTGCCCCCTACTTCCC 74
Query 75 TGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGT 148
.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 75 GGGACTGATGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAGT 148
Query 149 TTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGC 222
|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGGC 222
Query 223 CAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGA 296
||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| .||.||
Sbjct 223 CAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTGA 293
Query 297 CACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGA 370
|||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 294 CACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAGA 367
Query 371 CACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTC 444
|||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||
Sbjct 368 CACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTTC 441
Query 445 CGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG 518
||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 CGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG 515
Query 519 AGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACG 592
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 516 AGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCACG 589
Query 593 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTC 666
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 590 GTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGTC 663
Query 667 AACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCAC 740
|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 664 AACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCAC 737
Query 741 GGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG 814
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG 811
Query 815 CAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGT 888
|||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 812 CAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGGT 885
Query 889 CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCA 962
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 886 CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATCA 959
Query 963 AGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCA 1036
||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 960 AGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCCA 1033
Query 1037 CTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 CTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCA 1107
Query 1111 GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC 1181
Query 1185 A------------------------------------------------------------------------- 1185
|
Sbjct 1182 ATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGG 1255
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1256 CAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAAG 1329