Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_006522181.3
- Aligned Length:
- 1333
- Identities:
- 1025
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC-TCCTTACCTTC 73
|||| |..|.|.||.| |..|.|||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGA--GATCTGACAACGTGATCACC--- 24
Query 74 CTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAG 147
||| ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 25 ----ACT-------GGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAG 87
Query 148 TTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGG 221
||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 88 TTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGG 161
Query 222 CCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGG 295
|||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| .||.|
Sbjct 162 CCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTG 232
Query 296 ACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAG 369
||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 233 ACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAG 306
Query 370 ACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTT 443
||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct 307 ACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTT 380
Query 444 CCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC 517
|||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 CCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC 454
Query 518 GAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACAC 591
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 455 GAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCAC 528
Query 592 GGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGT 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 529 GGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGT 602
Query 666 CAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCA 739
||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 603 CAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCA 676
Query 740 CGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT 813
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 CGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT 750
Query 814 GCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGG 887
||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 751 GCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGG 824
Query 888 TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATC 961
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 825 TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATC 898
Query 962 AAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCC 1035
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 899 AAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCC 972
Query 1036 ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC 1109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 973 ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC 1046
Query 1110 AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC 1183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047 AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC 1120
Query 1184 CA------------------------------------------------------------------------ 1185
||
Sbjct 1121 CATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAG 1194
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1195 GCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAA 1268
Query 1186 - 1185
Sbjct 1269 G 1269