Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_017023330.1
- Aligned Length:
- 1264
- Identities:
- 1130
- Gaps:
- 113
Alignment
Query 1 -----ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTG--------CCT--ATGATTGTACC--G 57
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Sbjct 1 ATGAAATCTTGGCAGCTAA----------TTGCA-------GTCGTGGGAGATGCCCTTCAGGA---TATCAAA 54
Query 58 GCAG-CT-CCTTACCTTCCTG---------GACTGA-----TTCA----------------------------- 86
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Sbjct 55 GCAGACTGCAATACCTGCGTGGAAATAGAAGACAGAAAGGTTTCAAGACAACAGATGAATTGTGAAAGAGAGCA 128
Query 87 ------GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTC 154
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Sbjct 129 GCTAAGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTC 202
Query 155 CCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACC 228
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Sbjct 203 CCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACC 276
Query 229 ACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAG 302
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Sbjct 277 ACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAG 350
Query 303 CGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAAC 376
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Sbjct 351 CGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAAC 424
Query 377 CTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGAT 450
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Sbjct 425 CTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGAT 498
Query 451 CCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTC 524
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Sbjct 499 CCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTC 572
Query 525 AAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCG 598
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Sbjct 573 AAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCG 646
Query 599 TGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCT 672
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Sbjct 647 TGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCT 720
Query 673 TATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCT 746
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Sbjct 721 TATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCT 794
Query 747 GTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGC 820
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Sbjct 795 GTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGC 868
Query 821 CAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACC 894
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Sbjct 869 CAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACC 942
Query 895 GTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCC 968
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Sbjct 943 GTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGTGTTGTTTACCAGGA--- 1013
Query 969 TG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCC 1031
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Sbjct 1014 TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCC 1076
Query 1032 TGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCT 1105
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Sbjct 1077 TGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCT 1150
Query 1106 CTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTG 1179
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Sbjct 1151 CTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTG 1224
Query 1180 GTGCCA 1185
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Sbjct 1225 GTGCCA 1230