Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_017023337.1
- Aligned Length:
- 1219
- Identities:
- 1056
- Gaps:
- 137
Alignment
Query 1 ---ATGCTG--GCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCG-TGCCTA---TG---AT-TGTACCGGCAG 61
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Sbjct 1 ATGATGCAGCATCCTCTGACGGGGGCCACCTGC------GTGGCGCTCCCCAACGTGGGCATGTGTCCC--CAG 66
Query 62 CT--------CCTT-ACCTTCCTGGACTGA-TTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC 125
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Sbjct 67 CTTTCGTGTGCCTTGACTTTTATGTACTTACAGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC 140
Query 126 TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC 199
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Sbjct 141 TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC 214
Query 200 ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG 273
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Sbjct 215 ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG 288
Query 274 CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC 347
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Sbjct 289 CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC 362
Query 348 ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG 421
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Sbjct 363 ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG 436
Query 422 TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT 495
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Sbjct 437 TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT 510
Query 496 GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA 569
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Sbjct 511 GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA 584
Query 570 CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG 643
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Sbjct 585 CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG 658
Query 644 TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC 717
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Sbjct 659 TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC 732
Query 718 AGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCC 791
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Sbjct 733 AGTCCCGAATTCTATGCAG------------------------------------------------------- 751
Query 792 CAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG 865
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Sbjct 752 --------------------------TGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG 799
Query 866 GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG 939
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Sbjct 800 GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG 873
Query 940 GCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTAT 1002
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Sbjct 874 GCCTACGGCGGTGTTGTTTACCAGGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTAT 933
Query 1003 GCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGT 1076
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Sbjct 934 GCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGT 1007
Query 1077 TGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGC 1150
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Sbjct 1008 TGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGC 1081
Query 1151 ACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA 1185
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Sbjct 1082 ACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA 1116