Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03449
• Subject: XM_017316991.1
• Aligned Length: 1351
• Identities: 1007
• Gaps: 251

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT  66
                                                         ||| |||||   |       ||||||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT---  23

Query   67  TACCTTCCTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTC  140
                      ||       .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   24  ----------GA-------GGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTC  80

Query  141  GGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGT  214
            .||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   81  AGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGT  154

Query  215  ACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGC  288
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| 
Sbjct  155  ACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG-  227

Query  289  CCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCA  362
              .||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  228  --TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCA  299

Query  363  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCT  436
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  300  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTT  373

Query  437  TCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTT  510
            ||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  374  TCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTT  447

Query  511  AATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  584
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  AATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  521

Query  585  ATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAA  658
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  522  ATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGA  595

Query  659  AGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTAT  732
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  596  AGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTAT  669

Query  733  GCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATA  806
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  670  GCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATA  743

Query  807  TACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAG  880
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  744  TACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAG  817

Query  881  GCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTA  954
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  818  GCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGTGTT  891

Query  955  GTGTATCAAGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTATGCTGCATACCGCTAC  1017
            ||.||.||.||   ||   |.|||||           |||||        ||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  892  GTTTACCAGGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTAT  951

Query 1018  GCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAAT  1091
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  952  GCCCAGCCCACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAAT  1025

Query 1092  TTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCC  1165
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1026  TTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCC  1099

Query 1166  CACCTACGGCGTTGGTGCCA------------------------------------------------------  1185
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct 1100  CACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTT  1173

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1174  CCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCAT  1247

Query 1186  -------------------  1185
                               
Sbjct 1248  AGTCGCCCAGGAGAGAAAG  1266