Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03477
• Subject: XM_011514718.1
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1674
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA  74

Query   75  AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG  148

Query  149  AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT  222

Query  223  CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC  296

Query  297  CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA  370

Query  371  AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC  444

Query  445  CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG  518

Query  519  TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA  592

Query  593  AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA  666

Query  667  ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA  740

Query  741  AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC  814

Query  815  CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC  888

Query  889  TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC  962

Query  963  AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG  1036

Query 1037  TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA  1110

Query 1111  GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA  1184

Query 1185  CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1185  CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGT-----------------------  1235

Query 1259  TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA  1332
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  ----------------------------------------GATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA  1269

Query 1333  GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGGTTTTAGTGCCAAAGAACCCTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270  GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGGTTTTAGTGCCAAAGAACCCTGC  1343

Query 1407  GTTCATGGGGAAGATGGTTGAAGTGGACATCTATGAATCAGGCAAACATTTTATGAAAGGGCAGCCAGTATCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344  GTTCATGGGGAAGATGGTTGAAGTGGACATCTATGAATCAGGCAAACATTTTATGAAAGGGCAGCCAGTATCTG  1417

Query 1481  ATGCCAAAGTGTACACGCCCTCCATCAGCAAACCGCTAGCAAAGGGAGAAGTCTCGGGTTTGACAAAGGACTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1418  ATGCCAAAGTGTACACGCCCTCCATCAGCAAACCGCTAGCAAAGGGAGAAGTCTCGGGTTTGACAAAGGACTTC  1491

Query 1555  AGAAATGGGCTTGGGAACCAGCTGAGTTCAGGATCCCACACCTCTGCTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492  AGAAATGGGCTTGGGAACCAGCTGAGTTCAGGATCCCACACCTCTGCTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTC  1565

Query 1629  CAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCTACATCAAGACTGTGCGCTGAGGATGTCCGTGGGCTTGGCTCTGCTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566  CAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCTACATCAAGACTGTGCGCTGAGGATGTCCGTGGGCTTGGCTCTGCTGG  1639

Query 1703  GTCTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT  1737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640  GTCTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT  1674