Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03477
- Subject:
- XM_024446481.1
- Aligned Length:
- 1883
- Identities:
- 1585
- Gaps:
- 250
Alignment
Query 1 ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA 74
Query 75 AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG 148
Query 149 AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT 222
Query 223 CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC 296
Query 297 CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA 370
Query 371 AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC 444
Query 445 CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG 518
Query 519 TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA 592
Query 593 AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA 666
Query 667 ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA 740
Query 741 AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC 814
Query 815 CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC 888
Query 889 TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC 962
Query 963 AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG 1036
Query 1037 TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA 1110
Query 1111 GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA 1184
Query 1185 CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC 1258
Query 1259 TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA 1332
Query 1333 GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAG---------------GTTTTAGT 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1333 GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGATAAGAGGTGAAAATGTT----T 1402
Query 1392 GCCAAAGAACCCTGCGTTCATG----------------GGGAAGATGGTTGAA-------GTGGACATCT---A 1439
||.|..|| ||||| |.|||||| |.|||| |||||||..| |
Sbjct 1403 GCTATGGA---------TCATGGCTGGAATTAGAGCTTGAGAAGAT-GCTGAAGGCCAAGGTGGACAAGTCGGA 1466
Query 1440 TGA---ATCAGGCAAACATTTTATGAAAG--GGCAGCCAGTATCTGATGCC---AAAG-------TGTACACGC 1498
||| || .||||.| |.||| |||.|||.||.||.||.|.| |||| ||.|.|.||
Sbjct 1467 TGAGGGAT-GGGCAGA--------GGAAGCAGGCTGCCTGTGTCAGAAGGCAGGAAAGCAGGAGCTGAAGAGGC 1531
Query 1499 CC-------------TCC-------ATCA--GCAAAC------------CGCTAGCAAA---GGGAGAAGTCTC 1535
|| ||| |||| .||.|| |.|.||.||| ||||| ||
Sbjct 1532 CCCCAGCATTGACATTCCCCAGGGAATCATCTCAGACTGGGCAGTGCGTCCCCAGGAAACAGGGGAG----CT- 1600
Query 1536 GGGTTTGACAAAG----GACTTCAGAAATGGGC----TTGGGAACCAG------CTG-AGTTCAGGA-----TC 1589
||| ||||| |||| |||.|.|| ||..|.|||.| ||| ||||.|||| ||
Sbjct 1601 ---TTT--CAAAGCCCAGACT----AAACGTGCTCTGTTCAGTACCGGTGGAGACTGCAGTTGAGGAAGGGCTC 1665
Query 1590 CCA------CACCTCTG--CTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTCCAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCT 1655
||| ||..|||| |||||||.| ||||..|.| |.||||| ||
Sbjct 1666 CCAGCACTCCATGTCTGGCCTGCATCGC----------------TTCCCCATT-----TCCCCAT-------CT 1711
Query 1656 ACATCA--AGACTGTGCGCTGAGG---ATGTCCGTGGGCTT--GGC------TCTGCT------------GGGT 1704
|||.| |.|| |.|.|||| ||.|.|.| .|| ||| |||||| ||..
Sbjct 1712 -CATTAATATAC----CCCAGAGGGCCATTTTCCT---ATTCAGGCCAACCTTCTGCTCAGCCCTGGGGAGGAG 1777
Query 1705 CTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT 1737
||
Sbjct 1778 CT------------------------------- 1779