Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_03484
Subject:
NM_001317177.1
Aligned Length:
696
Identities:
681
Gaps:
15

Alignment

Query   1  ATGGGTGGGACCACCAGCACCCGCCGGGTCACCTTCGAGGCGGACGAGAATGAGAACATCACCGTGGTGAAGGG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGTGGGACCACCAGCACCCGCCGGGTCACCTTCGAGGCGGACGAGAATGAGAACATCACCGTGGTGAAGGG  74

Query  75  CATCCGGCTTTCGGAAAATGTGATTGATCGAATGAAGGAATCCTCTCCATCTGGTTCGAAGTCTCAGCGGTATT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CATCCGGCTTTCGGAAAATGTGATTGATCGAATGAAGGAATCCTCTCCATCTGGTTCGAAGTCTCAGCGGTATT  148

Query 149  CTGGTGCTTATGGTGCCTCAGTTTCTGATGAAGAATTGAAAAGAAGAGTAGCTGAGGAGCTGGCATTGGAGCAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CTGGTGCTTATGGTGCCTCAGTTTCTGATGAAGAATTGAAAAGAAGAGTAGCTGAGGAGCTGGCATTGGAGCAA  222

Query 223  GCCAAGAAAGAATCCGAAGATCAGAAACGACTAAAGCAAGCCAAAGAGCTGGACCGAGAGAGGGCTGCTGCCAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCAAGAAAGAATCCGAAGATCAGAAACGACTAAAGCAAGCCAAAGAGCTGGACCGAGAGAGGGCTGCTGCCAA  296

Query 297  TGAGCAGTTAACCAGAGCCATCCTTCGGGAGAGGATATGTAGCGAGGAGGAACGCGCTAAGGCAAAGCACCTG-  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 297  TGAGCAGTTAACCAGAGCCATCCTTCGGGAGAGGATATGTAGCGAGGAGGAACGCGCTAAGGCAAAGCACCTGG  370

Query 370  --------------GCTAGGCAGCTGGAAGAGAAAGACCGAGTGCTAAAGAAGCAGGATGCATTCTACAAAGAA  429
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATATTGAAGACAAAGCTAGGCAGCTGGAAGAGAAAGACCGAGTGCTAAAGAAGCAGGATGCATTCTACAAAGAA  444

Query 430  CAGCTGGCTAGACTGGAGGAGAGGAGCTCAGAGTTCTACAGAGTCACCACTGAACAATATCAGAAAGCTGCTGA  503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CAGCTGGCTAGACTGGAGGAGAGGAGCTCAGAGTTCTACAGAGTCACCACTGAACAATATCAGAAAGCTGCTGA  518

Query 504  AGAGGTGGAAGCAAAGTTCAAGCGATATGAGTCTCATCCAGTCTGTGCTGATCTGCAGGCCAAAATTCTTCAGT  577
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGAGGTGGAAGCAAAGTTCAAGCGATATGAGTCTCATCCAGTCTGTGCTGATCTGCAGGCCAAAATTCTTCAGT  592

Query 578  GTTACCGTGAGAACACCCACCAGACCCTCAAATGCTCCGCTCTGGCCACCCAGTATATGCACTGTGTCAATCAT  651
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GTTACCGTGAGAACACCCACCAGACCCTCAAATGCTCCGCTCTGGCCACCCAGTATATGCACTGTGTCAATCAT  666

Query 652  GCCAAACAGAGCATGCTTGAGAAGGGAGGA  681
           ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GCCAAACAGAGCATGCTTGAGAAGGGAGGA  696