Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03560
• Subject: NM_018242.3
• Aligned Length: 1710
• Identities: 1710
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGCTCCTGAGGAGCCCGCGCCAGTGCGCGGAGGCCCGGAGGCCACCCTTGAGGTCCGTGGGTCGCGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCTCCTGAGGAGCCCGCGCCAGTGCGCGGAGGCCCGGAGGCCACCCTTGAGGTCCGTGGGTCGCGCTG  74

Query   75  CTTGCGGCTGTCCGCCTTCCGAGAAGAGCTGCGGGCGCTCTTGGTCCTGGCTGGCCCCGCGTTCTTGGTTCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTGCGGCTGTCCGCCTTCCGAGAAGAGCTGCGGGCGCTCTTGGTCCTGGCTGGCCCCGCGTTCTTGGTTCAGC  148

Query  149  TGATGGTGTTCCTGATCAGCTTCATAAGCTCCGTGTTCTGTGGCCACCTGGGCAAGCTGGAGCTGGATGCAGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGGTGTTCCTGATCAGCTTCATAAGCTCCGTGTTCTGTGGCCACCTGGGCAAGCTGGAGCTGGATGCAGTC  222

Query  223  ACGCTGGCAATCGCGGTTATCAATGTCACTGGTGTCTCAGTGGGATTCGGCTTATCTTCTGCCTGTGACACCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACGCTGGCAATCGCGGTTATCAATGTCACTGGTGTCTCAGTGGGATTCGGCTTATCTTCTGCCTGTGACACCCT  296

Query  297  CATCTCCCAGACGTACGGGAGCCAGAACCTGAAGCACGTGGGCGTGATCCTGCAGCGGAGTGCGCTCGTCCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCTCCCAGACGTACGGGAGCCAGAACCTGAAGCACGTGGGCGTGATCCTGCAGCGGAGTGCGCTCGTCCTGC  370

Query  371  TCCTCTGCTGCTTCCCCTGCTGGGCGCTCTTTCTCAACACCCAGCACATCCTGCTGCTCTTCAGGCAGGACCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTCTGCTGCTTCCCCTGCTGGGCGCTCTTTCTCAACACCCAGCACATCCTGCTGCTCTTCAGGCAGGACCCA  444

Query  445  GATGTGTCCAGGCTTACCCAGACCTATGTCACGATCTTCATTCCAGCTCTTCCTGCAACCTTTCTTTATATGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGTGTCCAGGCTTACCCAGACCTATGTCACGATCTTCATTCCAGCTCTTCCTGCAACCTTTCTTTATATGTT  518

Query  519  ACAAGTTAAATATTTGCTCAACCAGGGAATTGTACTGCCCCAGATCGTAACTGGAGTTGCAGCCAACCTTGTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAAGTTAAATATTTGCTCAACCAGGGAATTGTACTGCCCCAGATCGTAACTGGAGTTGCAGCCAACCTTGTCA  592

Query  593  ATGCCCTCGCCAACTATCTGTTTCTCCATCAACTGCATCTTGGGGTGATAGGCTCTGCACTGGCAAACTTGATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCCCTCGCCAACTATCTGTTTCTCCATCAACTGCATCTTGGGGTGATAGGCTCTGCACTGGCAAACTTGATT  666

Query  667  TCCCAGTACACCCTGGCTCTACTCCTCTTTCTCTACATCCTCGGGAAAAAACTGCATCAAGCTACATGGGGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCAGTACACCCTGGCTCTACTCCTCTTTCTCTACATCCTCGGGAAAAAACTGCATCAAGCTACATGGGGAGG  740

Query  741  CTGGTCCCTCGAGTGCCTGCAGGACTGGGCCTCCTTCCTCCGCCTGGCCATCCCCAGCATGCTCATGCTGTGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGTCCCTCGAGTGCCTGCAGGACTGGGCCTCCTTCCTCCGCCTGGCCATCCCCAGCATGCTCATGCTGTGCA  814

Query  815  TGGAGTGGTGGGCCTATGAGGTCGGGAGCTTCCTCAGTGGCATCCTCGGCATGGTGGAGCTGGGCGCTCAGTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGTGGTGGGCCTATGAGGTCGGGAGCTTCCTCAGTGGCATCCTCGGCATGGTGGAGCTGGGCGCTCAGTCC  888

Query  889  ATCGTGTATGAACTGGCCATCATTGTGTACATGGTCCCTGCAGGCTTCAGTGTGGCTGCCAGTGTCCGGGTAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGTGTATGAACTGGCCATCATTGTGTACATGGTCCCTGCAGGCTTCAGTGTGGCTGCCAGTGTCCGGGTAGG  962

Query  963  AAACGCTCTGGGTGCTGGAGACATGGAGCAGGCACGGAAGTCCTCTACCGTTTCCCTGCTGATTACAGTGCTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAACGCTCTGGGTGCTGGAGACATGGAGCAGGCACGGAAGTCCTCTACCGTTTCCCTGCTGATTACAGTGCTCT  1036

Query 1037  TTGCTGTAGCCTTCAGTGTCCTGCTGTTAAGCTGTAAGGATCACGTGGGGTACATTTTTACTACCGACCGAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCTGTAGCCTTCAGTGTCCTGCTGTTAAGCTGTAAGGATCACGTGGGGTACATTTTTACTACCGACCGAGAC  1110

Query 1111  ATCATTAATCTGGTGGCTCAGGTGGTTCCAATTTATGCTGTTTCCCACCTCTTTGAAGCTCTTGCTTGCACGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCATTAATCTGGTGGCTCAGGTGGTTCCAATTTATGCTGTTTCCCACCTCTTTGAAGCTCTTGCTTGCACGAG  1184

Query 1185  TGGTGGTGTTCTGAGGGGGAGTGGAAATCAGAAGGTTGGAGCCATTGTGAATACCATTGGGTACTATGTGGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTGGTGTTCTGAGGGGGAGTGGAAATCAGAAGGTTGGAGCCATTGTGAATACCATTGGGTACTATGTGGTTG  1258

Query 1259  GCCTCCCCATCGGGATCGCGCTGATGTTTGCAACCACACTTGGAGTGATGGGTCTGTGGTCAGGGATCATCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCTCCCCATCGGGATCGCGCTGATGTTTGCAACCACACTTGGAGTGATGGGTCTGTGGTCAGGGATCATCATC  1332

Query 1333  TGTACAGTCTTTCAAGCTGTGTGTTTTCTAGGCTTTATTATTCAGCTAAATTGGAAAAAAGCCTGTCAGCAGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTACAGTCTTTCAAGCTGTGTGTTTTCTAGGCTTTATTATTCAGCTAAATTGGAAAAAAGCCTGTCAGCAGGC  1406

Query 1407  TCAGGTACACGCCAATTTGAAAGTAAACAACGTGCCTCGGAGTGGGAATTCTGCTCTCCCTCAGGATCCGCTTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGTACACGCCAATTTGAAAGTAAACAACGTGCCTCGGAGTGGGAATTCTGCTCTCCCTCAGGATCCGCTTC  1480

Query 1481  ACCCAGGGTGCCCTGAAAACCTTGAAGGAATTTTAACGAACGATGTTGGAAAGACAGGCGAGCCTCAGTCAGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCCAGGGTGCCCTGAAAACCTTGAAGGAATTTTAACGAACGATGTTGGAAAGACAGGCGAGCCTCAGTCAGAT  1554

Query 1555  CAGCAGATGCGCCAAGAAGAACCTTTGCCGGAACATCCACAGGACGGCGCTAAATTGTCCAGGAAACAGCTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCAGATGCGCCAAGAAGAACCTTTGCCGGAACATCCACAGGACGGCGCTAAATTGTCCAGGAAACAGCTGGT  1628

Query 1629  GCTGCGGCGAGGGCTTCTGCTCCTGGGGGTCTTCTTAATCTTGCTGGTGGGGATTTTAGTGAGATTCTATGTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGCGGCGAGGGCTTCTGCTCCTGGGGGTCTTCTTAATCTTGCTGGTGGGGATTTTAGTGAGATTCTATGTCA  1702

Query 1703  GAATTCAG  1710
            ||||||||
Sbjct 1703  GAATTCAG  1710