Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03562
• Subject: NM_018253.3
• Aligned Length: 2250
• Identities: 2217
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  74
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  41

Query   75  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  115

Query  149  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  189

Query  223  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  263

Query  297  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  337

Query  371  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  411

Query  445  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  485

Query  519  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  559

Query  593  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  633

Query  667  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  707

Query  741  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  781

Query  815  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  855

Query  889  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  929

Query  963  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1003

Query 1037  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1077

Query 1111  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1151

Query 1185  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1225

Query 1259  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1299

Query 1333  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1373

Query 1407  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1447

Query 1481  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1521

Query 1555  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1595

Query 1629  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1669

Query 1703  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1743

Query 1777  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1817

Query 1851  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1891

Query 1925  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1965

Query 1999  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2039

Query 2073  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2113

Query 2147  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2187

Query 2221  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2250
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2217