Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03562
• Subject: NM_139119.2
• Aligned Length: 2250
• Identities: 2250
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  74

Query   75  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  148

Query  149  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  222

Query  223  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  296

Query  297  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  370

Query  371  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  444

Query  445  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  518

Query  519  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  592

Query  593  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  666

Query  667  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  740

Query  741  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  814

Query  815  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  888

Query  889  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  962

Query  963  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1036

Query 1037  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1110

Query 1111  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1184

Query 1185  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1258

Query 1259  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1332

Query 1333  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1406

Query 1407  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1480

Query 1481  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1554

Query 1555  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1628

Query 1629  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1702

Query 1703  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1776

Query 1777  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1850

Query 1851  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1924

Query 1925  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1998

Query 1999  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2072

Query 2073  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2146

Query 2147  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2220

Query 2221  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2250
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2250