Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03576
- Subject:
- NM_001014451.3
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1283
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAA---GCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCA 71
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||.|||.|||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTG---AGTCGTTGAGCAACTTGCA 71
Query 72 GATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAG 142
..|.||||||||||||.|||||.||||||||||||| |.||.||||.||||.|.|||.|||.|||||.||||
Sbjct 72 TCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAG 145
Query 143 ATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC 216
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 ATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC 219
Query 217 ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCG 290
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 220 ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCG 293
Query 291 GCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCAT 364
|||
Sbjct 294 GCT----------------------------------------------------------------------- 296
Query 365 TACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCC 438
|||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 297 ----------------------CCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCC 348
Query 439 TTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATA 512
||.||..|.||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 349 TTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTA 422
Query 513 TGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATG 586
||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 423 TGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATG 496
Query 587 CCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTG 660
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 497 CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTG 570
Query 661 CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT 644
Query 735 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC 718
Query 809 TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATC 882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 719 TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATC 792
Query 883 AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA 956
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA 866
Query 957 GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA 940
Query 1031 CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG 1014
Query 1105 GAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 1178
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 1088
Query 1179 CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG 1162
Query 1253 ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG 1236
Query 1327 GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC 1310
Query 1401 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1344