Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03576
• Subject: NM_001363938.1
• Aligned Length: 1457
• Identities: 1354
• Gaps: 28

Alignment

Query    1  ATGGC--------CACCGACTCGT--------GGGCCCT--GGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTC  56
            |||||        | |.|.|.|||        |.|||||  ||||||...|.|.||....||  ||||  .|.|
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCTGC-CGGGCGCGTCCAAGATCGCGCCCTGCGGCGGTTTCCCATCACCCTGC--CTGT--GGGC  69

Query   57  GA--TGACCAATTTGCAGATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTAC  125
            ||  |||.|||.|||||..|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||   |.||.||||.||||.|.|
Sbjct   70  GACTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGC  143

Query  126  CACTGCCGAGAAAACAGATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAA  199
            ||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAA  217

Query  200  GCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAG  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  GCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAG  291

Query  274  TCGTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAA  347
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  292  TCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAA  365

Query  348  GATACAAGAGAACGCATTACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCA  421
            ||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  366  GATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTA  439

Query  422  CTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTG  495
            |||||||||||||||||||.||..|.||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.
Sbjct  440  CTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTA  513

Query  496  TGCCTCTCCCCAACATATGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGA  569
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  514  TGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGA  587

Query  570  ACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTG  643
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  ACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTG  661

Query  644  GCACCCCTGGGACCGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTT  717
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTT  735

Query  718  CTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCC  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  CTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCC  809

Query  792  CAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  CAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCC  883

Query  866  CAGACCCAAATGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGC  939
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  CAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGC  957

Query  940  AGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTT  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  AGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTT  1031

Query 1014  CTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGA  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  CTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGA  1105

Query 1088  GTGGGGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTG  1161
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  GTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTG  1179

Query 1162  ACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGA  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  ACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGA  1253

Query 1236  CAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCC  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCC  1327

Query 1310  TGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAG  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  TGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAG  1401

Query 1384  ATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  ATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1452