Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03576
- Subject:
- NM_007242.7
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1368
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAA---GCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCA 71
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||.|||.|||.|||||
Sbjct 1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTG---AGTCGTTGAGCAACTTGCA 71
Query 72 GATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAG 142
..|.||||||||||||.|||||.||||||||||||| |.||.||||.||||.|.|||.|||.|||||.||||
Sbjct 72 TCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAG 145
Query 143 ATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC 216
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 ATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC 219
Query 217 ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCG 290
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 220 ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCG 293
Query 291 GCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCAT 364
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCAT 367
Query 365 TACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCC 438
|.||..|||||||||||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 368 TGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCC 441
Query 439 TTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATA 512
||.||..|.||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 442 TTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTA 515
Query 513 TGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATG 586
||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 516 TGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATG 589
Query 587 CCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTG 660
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 590 CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTG 663
Query 661 CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT 737
Query 735 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC 811
Query 809 TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATC 882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 812 TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATC 885
Query 883 AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA 956
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA 959
Query 957 GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA 1033
Query 1031 CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG 1107
Query 1105 GAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 1178
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 1181
Query 1179 CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG 1255
Query 1253 ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG 1329
Query 1327 GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC 1403
Query 1401 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1437