Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03576
• Subject: NM_172284.5
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1269
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74
            |||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|...||||..|||.|||.|||||..|
Sbjct    1  ATGGCTACGGATTCTTGGGCCCTAGCAGTAGACGAACAGGAAGCCGCAGCTGAGTCTTTGAGCAACTTGCATCT  74

Query   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATG  145
            .|||||.||||||.|||||.|||||.|||||||   |.||.|.||.||||.|.|.|...|.|||||.|||||.|
Sbjct   75  TAAGGAGGAGAAAATCAAACCAGATGCCAATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGG  148

Query  146  AAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA  219
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  AAGATGAGAAAGAGGACAGAGCTGCTCAGTCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACC  222

Query  220  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCT  293
            ||||||||||||||||||||..||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  223  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGAGGGACCCAAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCT  296

Query  294  GAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCATTAC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct  297  GAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGC  370

Query  368  CCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTT  441
            |..|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACTTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTT  444

Query  442  GTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGA  515
            ||.||.||..|||||||||.|||.|||||..||.|||..|...||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  GTTTTGGCTGTGCTCAGCCAAGTAGAGCCTGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGA  518

Query  516  GCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCG  589
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  519  GCTTGCTCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG  592

Query  590  TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTG  663
            ||||||||||.||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||
Sbjct  593  TTCGAGGCAACAAATTGGAGAGGGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTG  666

Query  664  GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT  737
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  GACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGAT  740

Query  738  GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC  811
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGC  814

Query  812  TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAA  885
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||.
Sbjct  815  TTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAG  888

Query  886  CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT  959
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.||||||||
Sbjct  889  CTGAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTT  962

Query  960  CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG  1033
            |||||||.||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CCAGGCCCTGTGCAATCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAG  1036

Query 1034  CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAG  1107
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAG  1110

Query 1108  CAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  1181
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  1184

Query 1182  CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA  1255
            .||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  TGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACA  1258

Query 1256  ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC  1329
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGAC  1332

Query 1330  AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA  1403
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1333  AGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACACAGA  1406

Query 1404  TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            ||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1407  TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCAAC  1437