Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03577
• Subject: XM_006502058.3
• Aligned Length: 1053
• Identities: 865
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGAGCAACAATGGAGCAGACCTAACCTTTGGTTACATCTCCTGTTTTGTAGCTATCCTTTTGTTTGGCTCAAA  74
            |||||||.|||||.|.|||||||.|||...||.|||.||||||.|..||..||.|||||..||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGCAGCAATGCAACAGACCTCACCACCGGCTACCTCTCCTCTGCTGCGGCAATCCTCCTGTTTGGCTCCAA  74

Query   75  TTTTGTGCCACTTAAAAAATTTGATACTGGTGATGGAATGTTTCTCCAGTGGGTTCTTTGTGCTGCCATATGGT  148
            .|||||.|||||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  CTTTGTACCACTTAAAAAATATGACACTGGCGATGGGATGTTCCTTCAGTGGGTGCTCTGTGCTGCCATTTGGT  148

Query  149  TGGTTGCCTTGGTTGTCAATCTGATATTACATTGTCCAAAGTTTTGGCCTTTTGCAATGCTTGGGGGCTGCATT  222
            |||||||||||||.|||||..|||||.|.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TGGTTGCCTTGGTGGTCAACTTGATACTGCACTGCCCTAAATTCTGGCCGTTTGCGATGCTTGGCGGCTGCATT  222

Query  223  TGGGCAACAGGGAACATTGCTGTTGTCCCAATTATCAAAACCATTGGTTTAGGCCTTGGAATCTTAATCTGGGG  296
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  223  TGGGCAACAGGCAACATTGCTGTCGTTCCAATTATCAAAACCATCGGTTTAGGACTTGGAATCCTAATCTGGGG  296

Query  297  ATCATTTAATGCCTTAACTGGCTGGGCAAGCTCAAGGTTTGGCTGGTTTGGATTGGATGCAGAAGAAGTATCAA  370
            |||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  ATCATTTAACACCTTAACTGGCTGGGCAAGCTCAAGGTTTGGCTGGTTTGGGATGGATGCAGAAGAAGTGTCCA  370

Query  371  ATCCGCTGCTAAATTACATTGGAGCTGGGCTATCAGTAGTAAGTGCTTTCATATTTTTGTTCATCAAAAGTGAA  444
            |.||..||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||..|||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCAATGCTGAATTACGTTGGAGCTGGGCTGTCAGTAGTAAGTGCGCTCACGTTTTTGTTCATCAAAAGTGAA  444

Query  445  ATACCAAATAACACGTGTTCCA-------TGGATACCACTCCATTAATAACAGAGCATGTGATCAACACAACCC  511
            ||.||.||||||       |||       .|||.|||||.|||.|.||.|||||||.|||||||||||.||||.
Sbjct  445  ATTCCGAATAAC-------CCAGGCAGCTCGGACACCACACCACTGATGACAGAGCCTGTGATCAACAGAACCG  511

Query  512  AAGACCCCTGT---------TCCTGGGTGGATAAACTTTCTACAGTAC--ACCACCGCATAGTGGGCTGCAGTC  574
            |.||||...||         |||||||||||||.|||||||||  .||  ||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  512  AGGACCGGAGTGCGGATTCCTCCTGGGTGGATAGACTTTCTAC--CACGTACCACCGCATTGTGGGCTGCAGCC  583

Query  575  TTGCAGTGATATCTGGAGTACTCTATGGATCTACATTTGTGCCAATCATCTACATCAAGGACCACAGCAAAAGA  648
            ||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  584  TTGCGGTAATATCTGGAATACTCTACGGATCGACATTTGTGCCAATCATTTACATCAAGGATCACAGCAGAAGA  657

Query  649  AATGATAGTATATATGCAGGGGCAAGCCAATATGATTTAGACTATGTGTTTGCGCACTTCAGTGGCATCTTTCT  722
            |||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  658  AATGACAGCATGTACGCAGGCGCTAGCCAGTATGATTTAGACTACGTGTTCGCACACTCCAGTGGCATCTTTCT  731

Query  723  TACAAGTACTGTCTACTTTCTGGCCTACTGCATAGCCATGAAAAATAGTCCTAAACTATATCCTGAAGCAGTCC  796
            |||||||||.|||||||||.||||||||||..||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||.
Sbjct  732  TACAAGTACAGTCTACTTTGTGGCCTACTGTGTAGCCATGAAAAATAGGCCAAAGCTGTATCCAGAGGCAGTCT  805

Query  797  TACCAGGATTCCTGTCAGGAGTACTTTGGGCTATAGCTACCTGCTGTTGGTTCATAGCAAATCACTCTCTGAGT  870
            |||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct  806  TACCAGGCTTGCTGTCAGGGGTGCTGTGGGCCATCGCCACCTGCTGCTGGTTCATCGCCAACCACTCACTAAGC  879

Query  871  GCTGTGGTCAGTTTTCCAATAATCACTGCTGGTCCAGGATTTATAGCTGCAATGTGGGGTATCTTCATGTTTAA  944
            ||.|||.||||.||.||.||.||||||||||||||.|||.||||.||||||.|.|||||.||..||||.||.||
Sbjct  880  GCCGTGATCAGCTTCCCGATCATCACTGCTGGTCCTGGACTTATTGCTGCACTTTGGGGGATACTCATTTTCAA  953

Query  945  GGAAATAAAGGGTCTACAAAACTACCTATTAATGATACTTGCATTTTGCATCATCTTGACTGGAGCCTTATGCA  1018
            |||||||.|||||||.|.|||||||.||.|.|||||.||.||.||.|||||||||||..||||.|||||.||||
Sbjct  954  GGAAATACAGGGTCTCCGAAACTACTTACTGATGATGCTCGCTTTCTGCATCATCTTAGCTGGGGCCTTGTGCA  1027

Query 1019  CTGCTTTTTCTAAAATC  1035
            |.||||||||||||.|.
Sbjct 1028  CCGCTTTTTCTAAAGTG  1044