Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03639
- Subject:
- NM_001160042.2
- Aligned Length:
- 1638
- Identities:
- 1398
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGAGCCAGAGCTGCTGGTTCGGAAGGTGTCTGCATTGC---------------------------------- 40
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Sbjct 1 ATGGAGCCAGAGCTGCTGGTTCGGAAGGTGTCTGCATTGCAGGTGCGGGGGCGGGCGCGGGGTTCACAGGATTT 74
Query 41 -------------------------------------------------------------------------- 40
Sbjct 75 TTCCTTTAGGGAAATCATGGGGTCTCGTACCTGGACCTCCCAGCGAGATGCTACCACGTTCAGTCCCCTAACTG 148
Query 41 -------------------------------------------------------------------------- 40
Sbjct 149 CGCGCCAACCTCTGGAGATACCGGCTGTCCCCAACCGCGCTGAGGAAAGCTGGGACCCACGGACTCCCTGCCCT 222
Query 41 ----------------------------------------------------------AGGCCTGCGTCCGGGG 56
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Sbjct 223 GCGCGTCCCCACTCCCACCACACGCTCGCGCCGGATCAGGGAAACGGGAAGAGCCTTAAGGCCTGCGTCCGGGG 296
Query 57 CTTCTTGGTCCGACGCCAGTTCCAGAGCCTGCGAGCTGAGTATGAGGCGATTGTACGAGAGGTCGAGGGCGACC 130
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Sbjct 297 CTTCTTGGTCCGACGCCAGTTCCAGAGCCTGCGAGCTGAGTATGAGGCGATTGTACGAGAGGTCGAGGGCGACC 370
Query 131 TGGGCACGCTTCAGTGGACCGAGGGCCGCATTCCCAGGCCGCGATTCCTCCCAGAGAAGGCAAAATCCCATCAG 204
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Sbjct 371 TGGGCACGCTTCAGTGGACCGAGGGCCGCATTCCCAGGCCGCGATTCCTCCCAGAGAAGGCAAAATCCCATCAG 444
Query 205 ACCTGGAAAGCAGGAGACAGGGTAGCAAATCCAGAGCAGGGGCTGTGGAACCACTTCCCATGTGAAGAGTCTGA 278
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Sbjct 445 ACCTGGAAAGCAGGAGACAGGGTAGCAAATCCAGAGCAGGGGCTGTGGAACCACTTCCCATGTGAAGAGTCTGA 518
Query 279 GGGAGAGGCCACCTGGGAGGAGATGGTGCTGAAGAAGTCAGGAGAGAGCTCAGCAAATCAAGGAAGCCTCTGCA 352
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Sbjct 519 GGGAGAGGCCACCTGGGAGGAGATGGTGCTGAAGAAGTCAGGAGAGAGCTCAGCAAATCAAGGAAGCCTCTGCA 592
Query 353 GAGATCACAGCTCCTGGCTTCAGATGAAGCAGAACAGGAAACCCAGCCAAGAGAAGACCAGAGACACGACAAGG 426
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Sbjct 593 GAGATCACAGCTCCTGGCTTCAGATGAAGCAGAACAGGAAACCCAGCCAAGAGAAGACCAGAGACACGACAAGG 666
Query 427 ATGGAGAATCCAGAAGCCACAGATCAAAGACTGCCCCACAGCCAACCTCAGCTTCAAGAGCTTCAGTACCACCG 500
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Sbjct 667 ATGGAGAATCCAGAAGCCACAGATCAAAGACTGCCCCACAGCCAACCTCAGCTTCAAGAGCTTCAGTACCACCG 740
Query 501 CAGCCACTTGGCCATGGAATTGCTGTGGCTGCAACAGGCCATCAATAGCCGTAAGGAGTACCTACTTCTTAAAC 574
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Sbjct 741 CAGCCACTTGGCCATGGAATTGCTGTGGCTGCAACAGGCCATCAATAGCCGTAAGGAGTACCTACTTCTTAAAC 814
Query 575 AAACACTGAGATCCCCAGAGGCGGGCCCGATCAGAGAGGAACCCCGCGTGTTCCTAGAACATGGGGAACAGGCC 648
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Sbjct 815 AAACACTGAGATCCCCAGAGGCGGGCCCGATCAGAGAGGAACCCCGCGTGTTCCTAGAACATGGGGAACAGGCC 888
Query 649 TGTGAGAGGGACCAGTCACAACCAAGCGCACCACTGGAGGACCAGTCCTACAGAGACAGGACCACTGGAGAGCT 722
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Sbjct 889 TGTGAGAGGGACCAGTCACAACCAAGCGCACCACTGGAGGACCAGTCCTACAGAGACAGGACCACTGGAGAGCT 962
Query 723 AGAACAGGAGGATGACTCCTGTCACAGGGTCAAATCACCCCACAGATCCCCAGGAAGTTTGGCCACTACACAAA 796
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Sbjct 963 AGAACAGGAGGATGACTCCTGTCACAGGGTCAAATCACCCCACAGATCCCCAGGAAGTTTGGCCACTACACAAA 1036
Query 797 AAAACATTGCTGGGGCTAAGTGCAGAGAACCATGCTACAGCAAGTCTGGACCACCGTCGTCTATACCATCAAAC 870
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Sbjct 1037 AAAACATTGCTGGGGCTAAGTGCAGAGAACCATGCTACAGCAAGTCTGGACCACCGTCGTCTATACCATCAAAC 1110
Query 871 AGCCAGGCCTTGGGGGACAGGCTCACCAAAGGGCCAGACGATGGAAGACAGACCTTTGGAGGGACCTGCCTGCT 944
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Sbjct 1111 AGCCAGGCCTTGGGGGACAGGCTCACCAAAGGGCCAGACGATGGAAGACAGACCTTTGGAGGGACCTGCCTGCT 1184
Query 945 GCAGATGAAAATCCTGGAGGACCAGACCCCCAGAGGTTTAAAACCTAGGAACCATTGTCCCAGGAAGTCCAGGA 1018
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Sbjct 1185 GCAGATGAAAATCCTGGAGGACCAGACCCCCAGAGGTTTAAAACCTAGGAACCATTGTCCCAGGAAGTCCAGGA 1258
Query 1019 CACAGCTGTCTGCACTCTATGAGGACTCAAATATTAAGGAGATGTCTCCCAGAAAACTAGACCACAAAGAGCCT 1092
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Sbjct 1259 CACAGCTGTCTGCACTCTATGAGGACTCAAATATTAAGGAGATGTCTCCCAGAAAACTAGACCACAAAGAGCCT 1332
Query 1093 GACTGCCGAACAGTCAGGACACAAGAGTTGGGCCTCTCAGAGGACCACATCATCTGGGATGGTACCTTGGGGGG 1166
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Sbjct 1333 GACTGCCGAACAGTCAGGACACAAGAGTTGGGCCTCTCAGAGGACCACATCATCTGGGATGGTACCTTGGGGGG 1406
Query 1167 GCCAGAGCATAGTGTCCTCGATCTCTGGAGGACTAAACCACCCAAAGGCCAGGCCCCCACTGATAGAAGCTCCA 1240
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Sbjct 1407 GCCAGAGCATAGTGTCCTCGATCTCTGGAGGACTAAACCACCCAAAGGCCAGGCCCCCACTGATAGAAGCTCCA 1480
Query 1241 GAGATGGAACCTCCAATGAGCCTAGTCATGAAGGACAGAAAAAGCAGAGGACTATACCATGGAGATCAAAGTCA 1314
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Sbjct 1481 GAGATGGAACCTCCAATGAGCCTAGTCATGAAGGACAGAAAAAGCAGAGGACTATACCATGGAGATCAAAGTCA 1554
Query 1315 CCTGAGATTCTGTCTTCTACAAAGGCAGGCTGTACAGGAGAGGAACAGTGGAGGGGCAGGCCATGGAAAACAGA 1388
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Sbjct 1555 CCTGAGATTCTGTCTTCTACAAAGGCAGGCTGTACAGGAGAGGAACAGTGGAGGGGCAGGCCATGGAAAACAGA 1628
Query 1389 ACCACCTGGC 1398
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Sbjct 1629 ACCACCTGGC 1638