Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03722
• Subject: NM_001144002.1
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1758
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAGTACATCCTGGTCACGGGTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTACATCCTGGTCACGGGTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAAC  74

Query   75  GATTCTAAAATCATGTGGACTCCGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATTCTAAAATCATGTGGACTCCGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTT  148

Query  149  TTTCACCTTATGAACACGGTGAAGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTCACCTTATGAACACGGTGAAGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTAT  222

Query  223  GAAAGATTTTTGGATATTAATCTTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAGATTTTTGGATATTAATCTTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAA  296

Query  297  TAAAGAGAGGCGTGGTGATTACCTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGAGAGGCGTGGTGATTACCTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGT  370

Query  371  GGGTTATGAATCAAGCCAAGGTGCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGTTATGAATCAAGCCAAGGTGCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGA  444

Query  445  GGCACCATTGGAGACATCGAAGGAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCACCATTGGAGACATCGAAGGAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGA  518

Query  519  GAATTTCTGTAATATCCACGTTAGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATTTCTGTAATATCCACGTTAGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCC  592

Query  593  AAAACAGCGTCCGCGCACTGAGGGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAACAGCGTCCGCGCACTGAGGGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATT  666

Query  667  GAGATGGCCGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGATGGCCGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGT  740

Query  741  TTCTTCCACATACCGAGTTCCTGTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCTTCCACATACCGAGTTCCTGTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACC  814

Query  815  TGCCCATCGGTGATTCTGCAAGTAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCCATCGGTGATTCTGCAAGTAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAG  888

Query  889  AAAATATGCTCCATAGCCCTGGTTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAATATGCTCCATAGCCCTGGTTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCT  962

Query  963  GGAACACTCAGCCCTGGCCATCAACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGAAGATCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAACACTCAGCCCTGGCCATCAACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGAAGATCA  1036

Query 1037  CTGAAACCGAGGACCCTGTGAAATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAAACCGAGGACCCTGTGAAATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCCT  1110

Query 1111  GGAGGCTTTGGAATCAGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGGCTTTGGAATCAGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTTT  1184

Query 1185  TCTGGGAGTTTGTCTTGGGATGCAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGGGAGTTTGTCTTGGGATGCAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCTG  1258

Query 1259  ATTCCACAGAGTTTAGGCCAAATGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTCCACAGAGTTTAGGCCAAATGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTTG  1332

Query 1333  GGAGGAACAATGAGACTGGGAATAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGAGGAACAATGAGACTGGGAATAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATGG  1406

Query 1407  TGATGTTCCTTTTATAGAAGAAAGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATGTTCCTTTTATAGAAGAAAGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAGC  1480

Query 1481  AGAATGACTTAAGTTTTGTAGGTCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAATGACTTAAGTTTTGTAGGTCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCCT  1554

Query 1555  TATTTTGTTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATTTTGTTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGCT  1628

Query 1629  GTTACTTGCAGCAACTGGGAACCTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTGCAAACTGTCTTCCAGTGATAGATACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTTACTTGCAGCAACTGGGAACCTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTGCAAACTGTCTTCCAGTGATAGATACA  1702

Query 1703  GTGATGCCAGTGATGACAGCTTTTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGATGCCAGTGATGACAGCTTTTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC  1758