Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03722
- Subject:
- XM_006528915.1
- Aligned Length:
- 1761
- Identities:
- 1200
- Gaps:
- 381
Alignment
Query 1 ATGAAGTACATCCTGGTCACGGGTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GATTCTAAAATCATGTGGACTCCGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTCACCTTATGAACACGGTGAAGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAAAGATTTTTGGATATTAATCTTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TAAAGAGAGGCGTGGTGATTACCTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGGTTATGAATCAAGCCAAGGTGCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGA 444
||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1 -----ATGAATCAAGCCAAGGTGTCTGTGGATGGCAATAAGGAAGATCCCCAGATATGTGTTATTGAGCTGGGA 69
Query 445 GGCACCATTGGAGACATCGAAGGAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGA 518
|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||..||||.|||||||||||.||.||.|.|||
Sbjct 70 GGCACCATTGGAGACATTGAAGGAATGGCATTTGTGGAAGCATTCCGACAGTTCCAGTTTAAAGCCAAGAAAGA 143
Query 519 GAATTTCTGTAATATCCACGTTAGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCC 592
||||||||.||||||.||.||.||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 144 GAATTTCTATAATATTCATGTCAGCCTTGTGCCACAGCCCAGTGCTACTGGAGAACAAAAAACCAAGCCCACGC 217
Query 593 AAAACAGCGTCCGCGCACTGAGGGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATT 666
|||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 218 AAAACAGTGTCCGTGCGCTGAGAGGGTTGGGCTTGTCTCCGGATCTGATCGTCTGCCGTAGTTCAACCCCCATT 291
Query 667 GAGATGGCCGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGT 740
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 292 GAGATGGCTGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATCTGTATCCATGATGT 365
Query 741 TTCTTCCACATACCGAGTTCCTGTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACC 814
||||||||..||||||||.|||.|.|||||.|||||.|||.|..|.||.|||||||||.|.|||||||||..||
Sbjct 366 TTCTTCCATCTACCGAGTGCCTCTCCTTTTGGAGGAGCAAGGTGTGGTTAAATATTTTCAAGAGAGATTGGGCC 439
Query 815 TGCCCATCGGTGATTCTGCAAGTAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAG 888
||||||||..|||||.|.||||||||||||||||.|||||||.|...|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 440 TGCCCATCAATGATTGTTCAAGTAATTTGCTTTTCAAGTGGAAAGCCATGGCTGACAGGTATGAGAGATTGCAG 513
Query 889 AAAATATGCTCCATAGCCCTGGTTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCT 962
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 514 AAAATATGTTCCATAGCCCTGGTTGGTAAATACACCAAACTCAGGGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCACT 587
Query 963 GGAACACTCAGCCCTGGCCATCAACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAG-AAGATC 1035
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||| .|| ||
Sbjct 588 GGAACACTCAGCCTTGGCCATCAACCACAAGTTGAACCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGCCAG-TC 660
Query 1036 ACTGAAACCGAGGACCCTGTGAAATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCC 1109
||..||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||||||||
Sbjct 661 ACCAAAGCCGAGGATCCTGTGAAATTCCATGAAGCTTGGCAGAAGCTGTGCTTAGCTGATGGGATTCTTGTGCC 734
Query 1110 TGGAGGCTTTGGAATCAGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTT 1183
.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 735 CGGAGGGTTTGGAATCCGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCAATTTCGTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCAT 808
Query 1184 TTCTGGGAGTTTGTCTTGGGATGCAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCT 1257
||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 809 TTCTGGGAATTTGCCTTGGGATGCAACTGGCAGTGATTGAGTTTGCAAGAAACTGCCTGAACTTGAAAGATGCT 882
Query 1258 GATTCCACAGAGTTTAGGCCAAATGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTT 1331
.||||.|||||.|||..||||||..|.|||||.||..||||.|||||.|||||.||.||||||||||||.||||
Sbjct 883 AATTCTACAGAATTTGAGCCAAACACTCCAGTCCCATTGGTAATTGACATGCCTGAACACAACCCTGGCGATTT 956
Query 1332 GGGAGGAACAATGAGACTGGGAATAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATG 1405
|||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||.|||||||||.||.|||.|.|.|||.|||||||
Sbjct 957 GGGAGGAACAATGAGACTGGGGTTAAGACGAACTGTTTTCACAACTGAAAACTCCATACTGAAGAAGCTTTATG 1030
Query 1406 GTGATGTTCCTTTTATAGAAGAAAGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAG 1479
||||.|||||||..|||||||||||||||.|||||||.|..|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1031 GTGACGTTCCTTACATAGAAGAAAGACACCGACATCGCTATGAGGTGAACCCTAACCTGATCAACCAATTTGAG 1104
Query 1480 CAGAATGACTTAAGTTTTGTAGGTCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCC 1553
.|.||.|||.|..|||||||.|||.|||||||.|||||..|.|||||||||||..||||..||.|||.||||||
Sbjct 1105 AATAAAGACCTTTGTTTTGTCGGTGAGGATGTAGATGGGAAGAGGATGGAAATTGTTGAGTTGACAAGTCATCC 1178
Query 1554 TTATTTTGTTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGC 1627
.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1179 ATATTTCATTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCCTCTAGGCCAATGAAGCCTTCCCCTCCGTACCTGGGGC 1252
Query 1628 TGTTACTTGCAGCAACTGGGAACCTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTG--CAAACTGTCTTCCAGTGATAGAT 1699
|.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|..||||.|| |.|| |||.|||.|.|.|||||||.|||
Sbjct 1253 TCTTACTTGCAGCAACGGGGAATCTGAATGCCCATCTGCAGCA--GATGAACAAGCTGCCATACAGTGATGGAT 1324
Query 1700 ACAGTGATGCCAGTGATGACAGCTTTTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC 1758
|||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||.|.|.|||||..||||..|.|.|
Sbjct 1325 ACAGTGATGCCAGCGATGACAGCTTTCCAGAGGCAAAGCTTGCTGAACTGGATCTCAAC 1383
