Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03722
• Subject: XM_011545545.2
• Aligned Length: 1884
• Identities: 1758
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCACGATCTTGGCTCATTGCAACCTTCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGAAGTACATCCTGGTCACGG  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAGACTACAGATTATATCTGGGTGTTGGCACCCAGCCACTATTCTGCCAATGAAGTACATCCTGGTCACGG  148

Query   23  GTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAACGATTCTAAAATCATGTGGACTC  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAACGATTCTAAAATCATGTGGACTC  222

Query   97  CGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTTTTTCACCTTATGAACACGGTGA  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTTTTTCACCTTATGAACACGGTGA  296

Query  171  AGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTATGAAAGATTTTTGGATATTAATC  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTATGAAAGATTTTTGGATATTAATC  370

Query  245  TTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAATAAAGAGAGGCGTGGTGATTAC  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAATAAAGAGAGGCGTGGTGATTAC  444

Query  319  CTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGTGGGTTATGAATCAAGCCAAGGT  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGTGGGTTATGAATCAAGCCAAGGT  518

Query  393  GCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGAGGCACCATTGGAGACATCGAAG  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGAGGCACCATTGGAGACATCGAAG  592

Query  467  GAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGAGAATTTCTGTAATATCCACGTT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGAGAATTTCTGTAATATCCACGTT  666

Query  541  AGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCCAAAACAGCGTCCGCGCACTGAG  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCCAAAACAGCGTCCGCGCACTGAG  740

Query  615  GGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATTGAGATGGCCGTGAAGGAGAAGA  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATTGAGATGGCCGTGAAGGAGAAGA  814

Query  689  TTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGTTTCTTCCACATACCGAGTTCCT  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGTTTCTTCCACATACCGAGTTCCT  888

Query  763  GTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACCTGCCCATCGGTGATTCTGCAAG  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACCTGCCCATCGGTGATTCTGCAAG  962

Query  837  TAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAGAAAATATGCTCCATAGCCCTGG  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAGAAAATATGCTCCATAGCCCTGG  1036

Query  911  TTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCTGGAACACTCAGCCCTGGCCATC  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCTGGAACACTCAGCCCTGGCCATC  1110

Query  985  AACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGAAGATCACTGAAACCGAGGACCCTGTGAA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGAAGATCACTGAAACCGAGGACCCTGTGAA  1184

Query 1059  ATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCCTGGAGGCTTTGGAATCAGAGGAA  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCCTGGAGGCTTTGGAATCAGAGGAA  1258

Query 1133  CATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTTTTCTGGGAGTTTGTCTTGGGATG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTTTTCTGGGAGTTTGTCTTGGGATG  1332

Query 1207  CAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCTGATTCCACAGAGTTTAGGCCAAA  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCTGATTCCACAGAGTTTAGGCCAAA  1406

Query 1281  TGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTTGGGAGGAACAATGAGACTGGGAA  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTTGGGAGGAACAATGAGACTGGGAA  1480

Query 1355  TAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATGGTGATGTTCCTTTTATAGAAGAA  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATGGTGATGTTCCTTTTATAGAAGAA  1554

Query 1429  AGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAGCAGAATGACTTAAGTTTTGTAGG  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAGCAGAATGACTTAAGTTTTGTAGG  1628

Query 1503  TCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCCTTATTTTGTTGGTGTCCAGTTCC  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCCTTATTTTGTTGGTGTCCAGTTCC  1702

Query 1577  ATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGCTGTTACTTGCAGCAACTGGGAAC  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGCTGTTACTTGCAGCAACTGGGAAC  1776

Query 1651  CTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTGCAAACTGTCTTCCAGTGATAGATACAGTGATGCCAGTGATGACAGCTT  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTGCAAACTGTCTTCCAGTGATAGATACAGTGATGCCAGTGATGACAGCTT  1850

Query 1725  TTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC  1884