Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03753
- Subject:
- XM_006497937.1
- Aligned Length:
- 1197
- Identities:
- 1073
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA 74
Query 75 GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA 148
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA 148
Query 149 AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG 222
||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG 222
Query 223 TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC 296
Query 297 AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC 370
.||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 297 GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC 370
Query 371 AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG 444
..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 371 GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA 444
Query 445 GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA 518
||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 445 GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA 518
Query 519 AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACG------------ACGGTGCCTGACTTTCAGG 580
|||..||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACGTGTGAGGGCGATACGGTGCCTGACTTTCAGG 592
Query 581 AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCGCTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAG 654
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 593 AGACTAGACCTCGTAATTACATTCTATCGGCCAGCGCCTCCGCGCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAG 666
Query 655 CAGGAGCTCCGCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAG 728
||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 667 CAGGAGCTTCGAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAG 740
Query 729 TAGCACTCACGTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCT 802
.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGTACTCATGTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCT 814
Query 803 ACCGCCACATGCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAGATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCCGCC 876
||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 ACCGCCACATGCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGCCTGCC 888
Query 877 TCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCCAGCCT 950
||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||...|.|
Sbjct 889 TCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCTGTCTT 962
Query 951 GGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGCTCGGG 1024
|||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 963 GGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGCCCGGG 1036
Query 1025 TGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGC 1098
|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCTACAGC 1110
Query 1099 CTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACCTACTT 1172
|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1111 CTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACCTACCT 1184
Query 1173 GGAACTGCTCAGC 1185
||||||.||||||
Sbjct 1185 GGAACTTCTCAGC 1197