Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03753
• Subject: XM_006497938.1
• Aligned Length: 1202
• Identities: 1019
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACCCGGGCGGTGCAGTTCACGGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTTCAACATGAAGAAGCTGGCGTCGGACGCGGGCATCTTCTTCACTCGGGCGGTGCAGTTCACAGAGGA  74

Query   75  GAAATTTGGCCAGGCTGAGAAGACTGAGCTTGATGCCCACTTTGAAAACCTTCTGGCCCGGGCAGACAGCACCA  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGTTTGGCCAGGCTGAGAAGACGGAGCTTGACGCCCACTTTGAAAACCTCCTAGCTCGGGCAGACAGCACCA  148

Query  149  AGAACTGGACAGAGAAGATCTTGAGGCAGACAGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCCCGAGTGGAGGAG  222
            ||||||||||||||..||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTGGACAGAGCGGATCCTGAGGCAGACCGAGGTGCTGCTGCAGCCCAACCCCAGTGCTCGAGTGGAGGAG  222

Query  223  TTCCTGTATGAGAAGCTGGACAGGAAGGTCCCCTCAAGGGTCACCAACGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCTATATGAGAAGCTGGACAGAAAGGTGCCCTCGAGAGTCACCAATGGGGAGCTGCTGGCTCAGTACATGGC  296

Query  297  AGACGCGGCCAGTGAGCTGGGGCCGACCACCCCCTATGGGAAGACACTGATCAAGGTGGCAGAAGCTGAAAAGC  370
            .||.||.|||||.||||||||.||.|.|||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  297  GGAGGCAGCCAGCGAGCTGGGCCCCAGCACTCCCTACGGGAAGACGCTGATCAAGGTGTCAGAAGCTGAGAAGC  370

Query  371  AACTGGGAGCCGCGGAGAGGGATTTTATCCACACGGCCTCCATCAGCTTCCTCACACCCTTGCGCAACTTCCTG  444
            ..||.|||||.||.|||.|||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct  371  GCCTCGGAGCAGCAGAGCGGGATTTCATTCACACTGCCTCCCTCAGCTTCCTCACACCCCTGCGGAACTTCCTA  444

Query  445  GAGGGGGACTGGAAGACCATCTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTCCAAAACCGGCGTCTGGACTTGGATGCCTGCAA  518
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  GAGGGGGACTGGAAAACGATTTCGAAGGAGAGGCGGCTCCTGCAGAACCGGCGTCTTGACCTGGATGCCTGCAA  518

Query  519  AGCGAGGCTGAAGAAGGCCAAGGCTGCAGAAGCCAAAGCCACGACGGTGCCTGACTTTCAGGAGACTAGACCTC  592
            |||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||            |.|.|||            
Sbjct  519  AGCCCGGCTAAAGAAGGCCAAGGCAGCCGAAGCCAAAGCCACG------------TGTGAGG------------  568

Query  593  GTAATTACATTCTCTCGGCCAGCGCCTCCGCG--CTCTGGAATGATGAAGTGGACAAGGCCGAGCAGGAGCTCC  664
                                         |||  ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  569  -----------------------------GCGATCTTTGGAACGATGAAGTCGACAAGGCTGAGCAGGAGCTTC  613

Query  665  GCGTGGCCCAGACAGAGTTTGACCGGCAAGCAGAAGTGACCCGTCTCTTGCTGGAGGGAATCAGTAGCACTCAC  738
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct  614  GAGTGGCGCAGACAGAGTTTGACCGGCAGGCAGAAGTGACCCGTCTCCTGCTGGAGGGGATCAGCAGTACTCAT  687

Query  739  GTGAACCACCTGCGCTGCCTCCACGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTACGCACAGTGCTACCGCCACAT  812
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  688  GTGAACCACCTTCGCTGCCTCCATGAGTTCGTCAAGTCTCAGACAACCTACTATGCACAGTGCTACCGCCACAT  761

Query  813  GCTGGACTTGCAGAAGCAGCTGGGCAG---------------ATTTCCCGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGC  871
            ||||||..|||||||.|||||.|||||               ||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  GCTGGATCTGCAGAAACAGCTAGGCAGCTCCCAGGGTGCCATATTTCCAGGCACCTTCGTGGGCACCACAGAGC  835

Query  872  CCGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCCACCACTGCTGCGGCCACTATGCCTGTGGTGCCCTCTGTGGCC  945
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||..|||.|||.
Sbjct  836  CTGCCTCCCCACCCCTGAGCAGCACCTCACCTACCACCACTGCGGCCACCATGCCTGTGGTACCTACTGGGGCT  909

Query  946  AGCCTGGCCCCTCCAGGGGAGGCCTCGCTCTGCCTGGAAGAGGTGGCCCCCCCTGCCAGTGGGACCCGCAAAGC  1019
            ..|.||||||||||||..|||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  910  GTCTTGGCCCCTCCAGAAGAGGCAGCCCTCTGCCTGGAGGAGGTGGCTCCCCCAGCCAGTGGGACTCGAAAGGC  983

Query 1020  TCGGGTGCTCTATGACTACGAGGCAGCCGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCT  1093
            .|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  CCGGGTGCTCTACGACTACGAGGCAGCTGACAGCAGTGAGCTGGCCCTGCTGGCTGATGAGCTCATCACTGTCT  1057

Query 1094  ACAGCCTGCCTGGCATGGACCCTGACTGGCTCATTGGCGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTCCCTGTCACC  1167
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1058  ACAGCCTGCCAGGCATGGATCCCGACTGGCTCATTGGTGAGAGAGGCAACAAGAAGGGCAAGGTTCCTGTCACC  1131

Query 1168  TACTTGGAACTGCTCAGC  1185
            |||.|||||||.||||||
Sbjct 1132  TACCTGGAACTTCTCAGC  1149