Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03757
• Subject: XM_017024878.2
• Aligned Length: 984
• Identities: 693
• Gaps: 291

Alignment

Query   1  ATGGAAATAGTCTGGGAGGTGCTTTTTCTTCTTCAAGCCAATTTCATCGTCTGCATATCAGCTCAACAGAATTC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  ACCAAAAATCCATGAAGGCTGGTGGGCATACAAGGAGGTGGTCCAGGGAAGCTTTGTTCCAGTTCCTTCTTTCT  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GGGGATTGGTGAACTCAGCTTGGAATCTTTGCTCTGTGGGGAAACGGCAGTCGCCAGTCAACATAGAGACCAGT  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  CACATGATCTTCGACCCCTTTCTGACACCTCTTCGCATCAACACGGGGGGCAGGAAGGTCAGTGGGACCATGTA  296
                                                                                |||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------------------------------ATGTA  5

Query 297  CAACACTGGAAGACACGTATCCCTTCGCCTGGACAAGGAGCACTTGGTCAACATATCTGGAGGGCCCATGACAT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   6  CAACACTGGAAGACACGTATCCCTTCGCCTGGACAAGGAGCACTTGGTCAACATATCTGGAGGGCCCATGACAT  79

Query 371  ACAGCCACCGGCTGGAGGAGATCCGACTACACTTTGGGAGTGAGGACAGCCAAGGGTCGGAGCACCTCCTCAAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  80  ACAGCCACCGGCTGGAGGAGATCCGACTACACTTTGGGAGTGAGGACAGCCAAGGGTCGGAGCACCTCCTCAAT  153

Query 445  GGACAGGCCTTCTCTGGGGAGGTGCAGCTCATCCACTATAACCATGAGCTATATACGAATGTCACAGAAGCTGC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 154  GGACAGGCCTTCTCTGGGGAGGTGCAGCTCATCCACTATAACCATGAGCTATATACGAATGTCACAGAAGCTGC  227

Query 519  AAAGAGTCCAAATGGATTGGTGGTAGTTTCTATATTTATAAAAGTTTCTGATTCATCAAACCCATTTCTTAATC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228  AAAGAGTCCAAATGGATTGGTGGTAGTTTCTATATTTATAAAAGTTTCTGATTCATCAAACCCATTTCTTAATC  301

Query 593  GAATGCTCAACAGAGATACTATCACAAGAATAACATATAAAAATGATGCATATTTACTACAGGGGCTTAATATA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302  GAATGCTCAACAGAGATACTATCACAAGAATAACATATAAAAATGATGCATATTTACTACAGGGGCTTAATATA  375

Query 667  GAGGAACTATATCCAGAGACCTCTAGTTTCATCACTTACGATGGGTCGATGACTATCCCACCCTGCTATGAGAC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376  GAGGAACTATATCCAGAGACCTCTAGTTTCATCACTTACGATGGGTCGATGACTATCCCACCCTGCTATGAGAC  449

Query 741  AGCAAGTTGGATCATAATGAACAAACCTGTCTATATAACCAGGATGCAGATGCATTCCTTGCGCCTGCTCAGCC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450  AGCAAGTTGGATCATAATGAACAAACCTGTCTATATAACCAGGATGCAGATGCATTCCTTGCGCCTGCTCAGCC  523

Query 815  AGAACCAGCCATCTCAGATCTTTCTGAGCATGAGTGACAACTTCAGGCCTGTCCAGCCACTCAACAACCGCTGC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524  AGAACCAGCCATCTCAGATCTTTCTGAGCATGAGTGACAACTTCAGGCCTGTCCAGCCACTCAACAACCGCTGC  597

Query 889  ATCCGCACCAATATCAACTTCAGTTTACAGGGGAAGGACTGTCCAAACAACCGAGCCCAGAAGCTTCAGTATAG  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598  ATCCGCACCAATATCAACTTCAGTTTACAGGGGAAGGACTGTCCAAACAACCGAGCCCAGAAGCTTCAGTATAG  671

Query 963  AGTAAATGAATGGCTCCTCAAG  984
           ||||||||||||||||||||||
Sbjct 672  AGTAAATGAATGGCTCCTCAAG  693