Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03777
• Subject: NM_001177304.2
• Aligned Length: 987
• Identities: 672
• Gaps: 315

Alignment

Query   1  ATGTCAGGTGTGGTACCCACAGCCCCTGAACAGCCTGCAGGTGAAATGGAAAATCAAACAAAACCACCAGATCC  74
                                                        |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ---------------------------------------------ATGGAAAATCAAACAAAACCACCAGATCC  29

Query  75  AAGGCCTGATGCTCCTCCTGAATACAATTCTCATTTTTTACCAGGACCCCCTGGAACAGCTGTCCCTCCACCTA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  30  AAGGCCTGATGCTCCTCCTGAATACAATTCTCATTTTTTACCAGGACCCCCTGGAACAGCTGTCCCTCCACCTA  103

Query 149  CTGGCTACCCAGGAGGCTTGCCTATGGGATACTACAGTCCACAGCAACCCAGTACCTTCCCTTTGTACCAGCCA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104  CTGGCTACCCAGGAGGCTTGCCTATGGGATACTACAGTCCACAGCAACCCAGTACCTTCCCTTTGTACCAGCCA  177

Query 223  GTTGGTGGTATCCATCCTGTCCGGTATCAGCCTGGCAAATATCCTATGCCAAATCAGTCTGTTCCAATAACATG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178  GTTGGTGGTATCCATCCTGTCCGGTATCAGCCTGGCAAATATCCTATGCCAAATCAGTCTGTTCCAATAACATG  251

Query 297  GATGCCAGGGCCAACTCCTATGGCAAACTGCCCTCCTGGTCTGGAATACTTAGTTCAGTTGGACAACATACATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 252  GATGCCAGGGCCAACTCCTATGGCAAACTGCCCTCCTGGTCTGGAATACTTAGTTC------------------  307

Query 371  TTCTTCAGCATTTTGAGCCTCTGGAAATGATGACATGTTTTGAAACTAATAATAGATATGATATTAAAAACAAC  444
                                                                                     
Sbjct 308  --------------------------------------------------------------------------  307

Query 445  TCAGACCAGATGGTTTACATTGTAACCGAAGACACAGATGACTTTACCAGGAATGCCTATCGGACACTAAGGCC  518
                                                                                     
Sbjct 308  --------------------------------------------------------------------------  307

Query 519  CTTCGTCCTCCGGGTCACTGATTGTATGGGCCGAGAAATCATGACAATGCAGAGACCCTTCAGATGCACCTGCT  592
                                                                                     
Sbjct 308  --------------------------------------------------------------------------  307

Query 593  GTTGCTTCTGTTGCCCCTCTGCCAGACAAGAGCTGGAGGTGCAGTGTCCTCCTGGTGTCACCATTGGCTTTGTT  666
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308  ------------------------------AGCTGGAGGTGCAGTGTCCTCCTGGTGTCACCATTGGCTTTGTT  351

Query 667  GCGGAACATTGGAACCTGTGCAGGGCGGTGTACAGCATCCAAAATGAGAAGAAAGAAAATGTGATGAGAGTTCG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352  GCGGAACATTGGAACCTGTGCAGGGCGGTGTACAGCATCCAAAATGAGAAGAAAGAAAATGTGATGAGAGTTCG  425

Query 741  TGGGCCATGCTCAACCTATGGCTGTGGTTCAGATTCTGTTTTTGAGGTCAAATCCCTTGATGGCATATCCAACA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426  TGGGCCATGCTCAACCTATGGCTGTGGTTCAGATTCTGTTTTTGAGGTCAAATCCCTTGATGGCATATCCAACA  499

Query 815  TCGGCAGTATTATCCGGAAGTGGAATGGTTTGTTATCAGCAATGGCAGATGCTGACCATTTTGACATTCACTTC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500  TCGGCAGTATTATCCGGAAGTGGAATGGTTTGTTATCAGCAATGGCAGATGCTGACCATTTTGACATTCACTTC  573

Query 889  CCACTAGACCTGGATGTGAAGATGAAAGCCATGATTTTTGGAGCTTGCTTCCTCATTGACTTCATGTATTTTGA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574  CCACTAGACCTGGATGTGAAGATGAAAGCCATGATTTTTGGAGCTTGCTTCCTCATTGACTTCATGTATTTTGA  647

Query 963  AAGATCTCCACCACAACGTTCAAGA  987
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648  AAGATCTCCACCACAACGTTCAAGA  672