Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03777
• Subject: XM_024453687.1
• Aligned Length: 987
• Identities: 717
• Gaps: 270

Alignment

Query   1  ATGTCAGGTGTGGTACCCACAGCCCCTGAACAGCCTGCAGGTGAAATGGAAAATCAAACAAAACCACCAGATCC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCAGGTGTGGTACCCACAGCCCCTGAACAGCCTGCAGGTGAAATGGAAAATCAAACAAAACCACCAGATCC  74

Query  75  AAGGCCTGATGCTCCTCCTGAATACAATTCTCATTTTTTACCAGGACCCCCTGGAACAGCTGTCCCTCCACCTA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AAGGCCTGATGCTCCTCCTGAATACAATTCTCATTTTTTACCAGGACCCCCTGGAACAGCTGTCCCTCCACCTA  148

Query 149  CTGGCTACCCAGGAGGCTTGCCTATGGGATACTACAGTCCACAGCAACCCAGTACCTTCCCTTTGTACCAGCCA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CTGGCTACCCAGGAGGCTTGCCTATGGGATACTACAGTCCACAGCAACCCAGTACCTTCCCTTTGTACCAGCCA  222

Query 223  GTTGGTGGTATCCATCCTGTCCGGTATCAGCCTGGCAAATATCCTATGCCAAATCAGTCTGTTCCAATAACATG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GTTGGTGGTATCCATCCTGTCCGGTATCAGCCTGGCAAATATCCTATGCCAAATCAGTCTGTTCCAATAACATG  296

Query 297  GATGCCAGGGCCAACTCCTATGGCAAACTGCCCTCCTGGTCTGGAATACTTAGTTCAGTTGGACAACATACATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 297  GATGCCAGGGCCAACTCCTATGGCAAACTGCCCTCCTGGTCTGGAATACTTAGTTC------------------  352

Query 371  TTCTTCAGCATTTTGAGCCTCTGGAAATGATGACATGTTTTGAAACTAATAATAGATATGATATTAAAAACAAC  444
                                                                                     
Sbjct 353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query 445  TCAGACCAGATGGTTTACATTGTAACCGAAGACACAGATGACTTTACCAGGAATGCCTATCGGACACTAAGGCC  518
                                                                                     
Sbjct 353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query 519  CTTCGTCCTCCGGGTCACTGATTGTATGGGCCGAGAAATCATGACAATGCAGAGACCCTTCAGATGCACCTGCT  592
                                                                                     
Sbjct 353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query 593  GTTGCTTCTGTTGCCCCTCTGCCAGACAAGAGCTGGAGGTGCAGTGTCCTCCTGGTGTCACCATTGGCTTTGTT  666
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353  ------------------------------AGCTGGAGGTGCAGTGTCCTCCTGGTGTCACCATTGGCTTTGTT  396

Query 667  GCGGAACATTGGAACCTGTGCAGGGCGGTGTACAGCATCCAAAATGAGAAGAAAGAAAATGTGATGAGAGTTCG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397  GCGGAACATTGGAACCTGTGCAGGGCGGTGTACAGCATCCAAAATGAGAAGAAAGAAAATGTGATGAGAGTTCG  470

Query 741  TGGGCCATGCTCAACCTATGGCTGTGGTTCAGATTCTGTTTTTGAGGTCAAATCCCTTGATGGCATATCCAACA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 471  TGGGCCATGCTCAACCTATGGCTGTGGTTCAGATTCTGTTTTTGAGGTCAAATCCCTTGATGGCATATCCAACA  544

Query 815  TCGGCAGTATTATCCGGAAGTGGAATGGTTTGTTATCAGCAATGGCAGATGCTGACCATTTTGACATTCACTTC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545  TCGGCAGTATTATCCGGAAGTGGAATGGTTTGTTATCAGCAATGGCAGATGCTGACCATTTTGACATTCACTTC  618

Query 889  CCACTAGACCTGGATGTGAAGATGAAAGCCATGATTTTTGGAGCTTGCTTCCTCATTGACTTCATGTATTTTGA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619  CCACTAGACCTGGATGTGAAGATGAAAGCCATGATTTTTGGAGCTTGCTTCCTCATTGACTTCATGTATTTTGA  692

Query 963  AAGATCTCCACCACAACGTTCAAGA  987
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693  AAGATCTCCACCACAACGTTCAAGA  717