Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03781
• Subject: NM_001346155.1
• Aligned Length: 1656
• Identities: 1527
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG  74

Query   75  CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC  148

Query  149  TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC  222

Query  223  AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC  296

Query  297  GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG  370

Query  371  ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC  444

Query  445  TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA  518

Query  519  AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT  592

Query  593  TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG  666

Query  667  TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA  740

Query  741  AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG  814

Query  815  AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG  888

Query  889  GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA  962

Query  963  TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  963  TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGA----  1032

Query 1037  TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG  1110
                                                                                      
Sbjct 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032

Query 1111  GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG  1184
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  ---------------------------------------------------GATTCTGGAAACCAAAATGGAGG  1055

Query 1185  AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC  1129

Query 1259  ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT  1203

Query 1333  GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG  1277

Query 1407  CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG  1351

Query 1481  TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT  1425

Query 1555  CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC  1499

Query 1629  ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC  1527