Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03781
- Subject:
- NM_001346156.1
- Aligned Length:
- 1656
- Identities:
- 1137
- Gaps:
- 519
Alignment
Query 1 ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -ATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT 73
Query 593 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG 147
Query 667 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA 221
Query 741 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG 295
Query 815 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG 369
Query 889 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA 443
Query 963 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT 517
Query 1037 TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG 591
Query 1111 GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG 665
Query 1185 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC 739
Query 1259 ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ATTCTAATCTCTCAGAAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCACT 813
Query 1333 GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAAG 887
Query 1407 CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTTG 961
Query 1481 TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATTT 1035
Query 1555 CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTATC 1109
Query 1629 ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC 1656
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 ATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC 1137
