Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03781
• Subject: XM_006718992.3
• Aligned Length: 1657
• Identities: 1253
• Gaps: 401

Alignment

Query    1  ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAAAACAGAGAAAGATTCTGCAATAGAGAGAGAGAATTTGTATATAAATTTAAAGTAGGAAGTCAGTG  74

Query   75  CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTAGAACTGAGAGTGCCACTCAAATTTCCTGTTCAAGAGAATGCCAGTCATTTGCATGGACGTCTGATGCTGC  148

Query  149  TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACAGTTTACCGTGCTTTATAGAAAAAGACTTAAAAGAAGCTCTGACTCAGTTTATAGAAGAAGAATCCCTC  222

Query  223  AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCGATTATGATAGAGATGCTGAAGCATCCCTGGCAGCTGTGAAATCAGGTGAAGTAGATTTACATCAGCTGGC  296

Query  297  GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTACATGGGCCAAAGCTTATGCTGAGACCACGTTAGAGCATGCAAGGCCTGAAGAACCCAGCTGGGATGAAG  370

Query  371  ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTTGCAGATGTGTACCATGACTTAATTCATTCTCCTGCCTCTGAAACTCTCTTAAATTTGGAACATAATTAC  444

Query  445  TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGTTAGTATCTCAGAACTGATTGGTGAAAGAGATGTGGAGCTGAAAAAATTACGAGAGAGACAAGGTATTGA  518

Query  519  AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGGAAAAAGTCATGCAGGAATTGGGAAAATCACTGACAGATCAAGATGTAAATTCACTGGCTGCTCAGCATT  592

Query  593  TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAATCCCAGCAAGACCTAGAAAATAAATGGTCGAATGAATTAAAACAATCAACTGCCATCCAAAAACAAGAG  666

Query  667  TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATCAAGAATGGGTAATAAAACTTCACCAAGACCTAAAAAACCCCAACAACAGCTCCCTTAGTGAGGAAATTAA  740

Query  741  AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTCAGCCAAGTCAGTTCAGAGAATCTGTAGAAGCAATTGGAAGGATTTATGAGGAACAGAGAAAGTTAGAAG  814

Query  815  AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGTTTTACCATTCACTTAGGAGCCCAGTTGAAGACCATGCATAATTTGAGATTGCTGAGAGCAGATATGCTG  888

Query  889  GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTCTGTAAGCATAAAAGAAATCATCGAAGTGGTGTGAAACTTCATCGGCTCCAAACAGCTCTGTCACTTTA  962

Query  963  TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCTACATCTCTCTGTGGCCTGGTTTTACTAGTAGATAATCGAATTAATTCATATAGTGGTATTAAAAGAGATT  1036

Query 1037  TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCCACAGTTTGCCAAGAATGCACTGACTTCCATTTCCCCCGAATTGAAGAGCAATTAGAAGTTGTCCAACAG  1110

Query 1111  GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGGTACTTTATGCTAGAACCCAGCGCAGGAGTAAATTGAAAGAATCACTTGATTCTGGAAACCAAAATGGAGG  1184

Query 1185  AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCTGGGGAATTTTATATTACACGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                
Sbjct 1185  AAATGATGATAAGACTAAGAATGCTGAGAGGAACTATTTAAATGTTTTACCT--GGAA----------------  1240

Query 1259  ATTCTAATCTCTCAG-AAATCCATGTTGCTTTCCATCTCTGTGTGGATGACCATGTGAAATCGGGAAACATCAC  1331
               |||      ||| ||||.||.|.                                                
Sbjct 1241  ---CTA------CAGAAAATACAAGC------------------------------------------------  1257

Query 1332  TGCTCGTGATCCTGCCATTATGGGACTCCGAAATATACTCAAAGTTTGCTGTACCCATGACATCACAACAATAA  1405
                                                                                      
Sbjct 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257

Query 1406  GCATTCCTCTCTTGCTGGTACATGATATGTCAGAGGAAATGACTATACCCTGGTGCTTAAGGAGAGCGGAACTT  1479
                                                                                      
Sbjct 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257

Query 1480  GTGTTCAAGTGTGTCAAAGGTTTCATGATGGAAATGGCTTCATGGGATGGAGGAATTTCTAGGACAGTGCAATT  1553
                                                                                      
Sbjct 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257

Query 1554  TCTAGTACCACAGAGTATTTCTGAAGAAATGTTTTATCAACTTAGTAACATGCTTCCCCAGATCTTCCGAGTAT  1627
                                                                                      
Sbjct 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257

Query 1628  CATCAACACTCACTCTGACATCCAAGCAC  1656
                                         
Sbjct 1258  -----------------------------  1257