Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03793
• Subject: NM_153828.3
• Aligned Length: 1176
• Identities: 1119
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGAAGACCTGGACCAGTCTCCTCTGGTCTCGTCCTCGGACAGCCCACCCCGGCCGCAGCCCGCGTTCAAGTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGACCTGGACCAGTCTCCTCTGGTCTCGTCCTCGGACAGCCCACCCCGGCCGCAGCCCGCGTTCAAGTA  74

Query   75  CCAGTTCGTGAGGGAGCCCGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGAGGACGAAGACCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGTTCGTGAGGGAGCCCGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGACGAGGACGAAGACCTGG  148

Query  149  AGGAGCTGGAGGTGCTGGAGAGGAAGCCCGCCGCCGGGCTGTCCGCGGCCCCAGTGCCCACCGCCCCTGCCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGCTGGAGGTGCTGGAGAGGAAGCCCGCCGCCGGGCTGTCCGCGGCCCCAGTGCCCACCGCCCCTGCCGCC  222

Query  223  GGCGCGCCCCTGATGGACTTCGGAAATGACTTCGTGCCGCCGGCGCCCCGGGGACCCCTGCCGGCCGCTCCCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCGCGCCCCTGATGGACTTCGGAAATGACTTCGTGCCGCCGGCGCCCCGGGGACCCCTGCCGGCCGCTCCCCC  296

Query  297  CGTCGCCCCGGAGCGGCAGCCGTCTTGGGACCCGAGCCCGGTGTCGTCGACCGTGCCCGCGCCATCCCCGCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTCGCCCCGGAGCGGCAGCCGTCTTGGGACCCGAGCCCGGTGTCGTCGACCGTGCCCGCGCCATCCCCGCTGT  370

Query  371  CTGCTGCCGCAGTCTCGCCCTCCAAGCTCCCTGAGGACGACGAGCCTCCGGCCCGGCCTCCCCCTCCTCCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCTGCCGCAGTCTCGCCCTCCAAGCTCCCTGAGGACGACGAGCCTCCGGCCCGGCCTCCCCCTCCTCCCCCG  444

Query  445  GCCAGCGTGAGCCCCCAGGCAGAGCCCGTGTGGACCCCGCCAGCCCCGGCTCCCGCCGCGCCCCCCTCCACCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCAGCGTGAGCCCCCAGGCAGAGCCCGTGTGGACCCCGCCAGCCCCGGCTCCCGCCGCGCCCCCCTCCACCCC  518

Query  519  GGCCGCGCCCAAGCGCAGGGGCTCCTCGGGCTCAGTGGATGAGACCCTTTTTGCTCTTCCTGCTGCATCTGAGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  519  GGCCGCGCCCAAGCGCAGGGGCTCCTCGGGCTCAGTG-------------------------------------  555

Query  593  CTGTGATACGCTCCTCTGCAGTTGTTGACCTCCTGTACTGGAGAGACATTAAGAAGACTGGAGTGGTGTTTGGT  666
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  --------------------GTTGTTGACCTCCTGTACTGGAGAGACATTAAGAAGACTGGAGTGGTGTTTGGT  609

Query  667  GCCAGCCTATTCCTGCTGCTTTCATTGACAGTATTCAGCATTGTGAGCGTAACAGCCTACATTGCCTTGGCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  GCCAGCCTATTCCTGCTGCTTTCATTGACAGTATTCAGCATTGTGAGCGTAACAGCCTACATTGCCTTGGCCCT  683

Query  741  GCTCTCTGTGACCATCAGCTTTAGGATATACAAGGGTGTGATCCAAGCTATCCAGAAATCAGATGAAGGCCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  GCTCTCTGTGACCATCAGCTTTAGGATATACAAGGGTGTGATCCAAGCTATCCAGAAATCAGATGAAGGCCACC  757

Query  815  CATTCAGGGCATATCTGGAATCTGAAGTTGCTATATCTGAGGAGTTGGTTCAGAAGTACAGTAATTCTGCTCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CATTCAGGGCATATCTGGAATCTGAAGTTGCTATATCTGAGGAGTTGGTTCAGAAGTACAGTAATTCTGCTCTT  831

Query  889  GGTCATGTGAACTGCACGATAAAGGAACTCAGGCGCCTCTTCTTAGTTGATGATTTAGTTGATTCTCTGAAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  GGTCATGTGAACTGCACGATAAAGGAACTCAGGCGCCTCTTCTTAGTTGATGATTTAGTTGATTCTCTGAAGTT  905

Query  963  TGCAGTGTTGATGTGGGTATTTACCTATGTTGGTGCCTTGTTTAATGGTCTGACACTACTGATTTTGGCTCTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  TGCAGTGTTGATGTGGGTATTTACCTATGTTGGTGCCTTGTTTAATGGTCTGACACTACTGATTTTGGCTCTCA  979

Query 1037  TTTCACTCTTCAGTGTTCCTGTTATTTATGAACGGCATCAGGCACAGATAGATCATTATCTAGGACTTGCAAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  TTTCACTCTTCAGTGTTCCTGTTATTTATGAACGGCATCAGGCACAGATAGATCATTATCTAGGACTTGCAAAT  1053

Query 1111  AAGAATGTTAAAGATGCTATGGCTAAAATCCAAGCAAAAATCCCTGGATTGAAGCGCAAAGCTGAA  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  AAGAATGTTAAAGATGCTATGGCTAAAATCCAAGCAAAAATCCCTGGATTGAAGCGCAAAGCTGAA  1119