Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03848
- Subject:
- XM_005263166.4
- Aligned Length:
- 1368
- Identities:
- 942
- Gaps:
- 426
Alignment
Query 1 ATGGATAGCCGCTTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGACAGCTCCTCGCGCAGCAGTTGGGAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATAGCCGCTTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGACAGCTCCTCGCGCAGCAGTTGGGAGC 74
Query 75 TGAAAGTGCCGACAGCATTGGTGCCGTGTTAAATAGCAAAGATGAGCAGAGAGAAATTGCTGAAACAAGAGAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAAAGTGCCGACAGCATTGGTGCCGTGTTAAATAGCAAAGATGAGCAGAGAGAAATTGCTGAAACAAGAGAAA 148
Query 149 CTTGCAGGGCTTCCTATGATACCTCTGCTCCAAATGCAAAACGTAAGTATCTGGATGAAGGAGAGACAGATGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTTGCAGGGCTTCCTATGATACCTCTGCTCCAAATGCAAAACGTAAGTATCTGGATGAAGGAGAGACAGATGAA 222
Query 223 GACAAAATGGAAGAATATAAGGATGAACTAGAAATGCAACAGGATGAAGAAAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACAAAATGGAAGAATATAAGGATGAACTAGAAATGCAACAGGATGAAGAAAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT 296
Query 297 TTACAAAGATTCTAGTACTTTTCTTAAGGGAACACAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTACAAAGATTCTAGTACTTTTCTTAAGGGAACACAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG 370
Query 371 TAGACACTGGACATAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATATCCTAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGACACTGGACATAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATATCCTAAA 444
Query 445 CTGAGGGAGCTCATCAGGCTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAATCTAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGAGGGAGCTCATCAGGCTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAATCTAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCCGA 518
Query 519 TATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAACTAACACCCAAATTTGATGTGATTCTTCTGGAACCCCCTTTAGAAGAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAACTAACACCCAAATTTGATGTGATTCTTCTGGAACCCCCTTTAGAAGAAT 592
Query 593 ATTACAGAGAAACTGGCATCACTGCTAATGAAAAATGCTGGACTTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATTACAGAGAAACTGGCATCACTGCTAATGAAAAATGCTGGACTTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATTGAT 666
Query 667 GAGATTGCAGCACCTCGATCATTTATTTTTCTCTGGTGTGGTTCTGGGGAGGGGTTGGACCTTGGAAGAGTGTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGATTGCAGCACCTCGATCATTTATTTTTCTCTGGTGTGGTTCTGGGGAGGGGTTGGACCTTGGAAGAGTGTG 740
Query 741 TTTACGAAAATGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGGAAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTACGAAAATGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGGAAGA 814
Query 815 CTAAGACTTTAGATCCAAAGGCTGTCTTTCAGAGAACAAAGGAACACTGCCTCATGGGGATCAAAGGAACTGTG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTAAGACTTTAGATCCAAAGGCTGTCTTTCAGAGAACAA----------------------------------- 853
Query 889 AAGCGTAGCACAGACGGGGACTTCATTCATGCTAATGTTGACATTGACTTAATTATCACAGAAGAACCTGAAAT 962
Sbjct 854 -------------------------------------------------------------------------- 853
Query 963 TGGCAATATAGAAAAACCTGTAGAAATTTTTCATATAATTGAGCATTTTTGTCTTGGTAGAAGACGCCTTCATC 1036
Sbjct 854 -------------------------------------------------------------------------- 853
Query 1037 TATTTGGAAGAGATAGTACAATTCGACCAGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAATAGCAACTACAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 ----------------------------AGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAATAGCAACTACAAT 899
Query 1111 GCAGAAACATATGCATCCTATTTCAGTGCTCCTAATTCCTACTTGACTGGTTGTACAGAAGAAATTGAGAGACT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCAGAAACATATGCATCCTATTTCAGTGCTCCTAATTCCTACT------------------------------- 942
Query 1185 TCGACCAAAATCGCCTCCTCCCAAATCTAAATCTGACCGAGGAGGTGGAGCTCCCAGAGGTGGAGGAAGAGGTG 1258
Sbjct 943 -------------------------------------------------------------------------- 942
Query 1259 GAACTTCTGCTGGCCGTGGACGAGAAAGAAATAGATCTAACTTCCGAGGAGAAAGAGGTGGCTTTAGAGGGGGC 1332
Sbjct 943 -------------------------------------------------------------------------- 942
Query 1333 CGTGGAGGAGCACACAGAGGTGGCTTTCCACCTCGA 1368
Sbjct 943 ------------------------------------ 942